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菠萝蜜WRKY基因家族注释及在低温胁迫下的表达模式分析
目录
一、内容概括................................................2
1.菠萝蜜的重要性........................................2
2.WRKY基因家族的研究意义................................3
3.低温胁迫对植物的影响..................................5
4.研究目的与内容........................................5
二、材料与方法..............................................6
1.实验材料..............................................7
菠萝蜜品种选择.........................................8
低温胁迫处理条件.......................................9
2.实验方法..............................................9
基因组数据获取........................................10
WRKY基因家族成员鉴定..................................12
表达模式分析..........................................13
数据处理与统计分析....................................13
三、菠萝蜜WRKY基因家族注释.................................15
1.WRKY基因家族成员概览.................................16
2.功能注释.............................................17
WRKY结构域分析........................................18
运动蛋白结合位点分析..................................19
抗氧化酶活性预测......................................20
3.信号通路关联分析.....................................21
与胁迫响应相关的信号通路..............................22
WRKY基因家族与胁迫响应基因的互作分析..................24
四、低温胁迫下菠萝蜜WRKY基因的表达模式分析.................26
1.总体表达模式.........................................27
2.个体差异表达模式.....................................28
不同组织部位的基因表达差异............................29
不同植株类型的基因表达差异............................30
3.环境因素交互作用分析.................................31
五、结论与讨论.............................................32
1.菠萝蜜WRKY基因家族的功能特点.........................34
2.低温胁迫下WRKY基因的表达调控机制.....................35
3.菠萝蜜WRKY基因家族在抗逆过程中的作用.................37
4.研究的局限性与未来展望...............................38
一、内容概括
本文主要研究了菠萝蜜WRKY基因家族的注释及在低温胁迫下的表达模式分析。我们通过对菠萝蜜基因组进行测序和比对，建立了一个包含所有已知WRKY基因家族的基因列表。我们利用DAVID数据库对这些基因进行了注释，并筛选出了与生长发育、营养状况、环境逆境等关键过程密切相关的功能基因。为了进一步研究这些基因在低温胁迫下的表达模式，我们采用了不同的实验设计，包括实时荧光定量PCR(qRTPCR)
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