浅谈第三代基因测序仪的技术调研报告 .pdfVIP

浅谈第三代测序仪的技术调研

基因测序仪的研发是系统工程,涉及生物、半导体、计算机、化学、光学等多

个领域,需要不同学科顶尖力量的合作。目前真正被称为第三代测序技术的分别是

“PacificBiosciences公司的单分子实时(SingleMoleculeRealTime,SMRT)

测序技术”,“Helicos公司的单分子测序技术”和“OxfordNanopore

Technologies公司正在研究的纳米孔单分子测序技术”。

一、技术特点

与二代测序仪比,三代测序仪完全是革命性的,正向着高通量、低成本、长读

取长度的方向发展。它具有明显的几个优点:(1)单分子测序,大大提高了样本的通

量和检测的速度;(2)RNA直接测序,大大降低了体外逆转录产生的系统误差;(3)长

片段测序,大大提高DNA聚合酶内在自身的延续性。

二、技术应用

第三代测序仪因为其高通量以及高速度、高准确度等优点,可广泛用于人类基

因组测序生命科学、生物化学、生物医药等领域,对于生命健康研究起到了本质的

推动作用。

三、国外市场现状

全球一批制药、育种、新材料等科技机构和企业都进入基因组应用领域。

2013年全球测序产品及服务市场约50亿美元,如果加上基因测序下游应用的市场

规模,这一数字达到200亿美元以上,预估之后以年平均成长率(CAGR)22%扩大,2020

年全球测序产品及服务市场规模将达到200亿美元,下游应用空间更是千亿美元以

上。目前国际知名三代测序行业企业一共有六家,按其技术成熟度排列如下:

1、PacificBiosciences,第一款产品PacBioRS在2011年正

式发布并商用。2013年4月发布了升级版PacBioRSⅡ。2013年9月

份,PacificBiosciences宣布与RocheDiagnostics合作,利用PacificBio的技

术致力于体外诊断产品开发,Roche为该项目提供7500万美元资金支持。作为第三

代测序技术的代表,也是目前唯一面市的PacBioRS系统。

2、Illumina,现今占据了高通量测序的主导地位,拥有世界高通量测序市场

70%左右的份额。2010年以来,Illumina相继推出Hiseq2000、Miseq、Hiseq2500

测序平台,使基因测序从大型实验室逐步向中小型实验室发展,并逐步实现“一天一

个基因组”的愿望。到2011年5月,illumina已经可以实现以4000美元提供测序

服务。

3、LifeTechnologies,LifeTechnologies分公司已遍布全球180多个国家,

拥有超过5000项知识产权专利和专有许可证。其旗下的IonTorrent是着名的第

一款商用离子半导体DNA测序平台。

4、Helicos,作为第三代测序仪的先驱——第一台单分子测序仪HeliScope正

是美国Helicos公司的杰作,它的出现真正实现了单分子测序。阻碍HeliScope热

卖的一个重要原因是售价太高,价格大约为99.9万美元。到2012年11月中

旬,Helicos正式宣布破产。

5、CompleteGenomics,并不出售测序仪,但用自己的测序仪来完成所有的内

部工作。公司曾宣称他们将在2009年以5000美元的价格售卖人类基因组。2013

年3月18日被深圳华大基因收购。

6、OxfordNanopore,2012年2月份,OxfordNanopore发布了一系列纳米孔

DNA测序和蛋白质分析数据,并向外界展示了它的GridIONTM系统和MinIONTM设

备,产业化仍未实现。

四、国内市场现状

目前我国基因测序能力迅速增长,国内测序公司早已遍地开花。

我国基因测序服务产品以科技服务为主。但长期以来我国基因检测行业处于

无监管状态,直到2014年才发布了行业第一个规范。国内市场基本被华大基因、贝

瑞和康、达安基因三家公司垄断。

目前国内企业要开展基因检测业务有两种途径,一是按照卫计委规定申报临床

试点,通过审批后可合法进行包括无创产前基因检测等业务;二是通过和Illumina

合作贴牌,向CFDA申请注册新型基因检测设备。由于第二种