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蛋白质组学原理及应用案例

陈希

水生所分测中心蛋白质组学平台

2020.6.12

个人简介

2000-2004本科

武汉大学

生命科学学院

2004-2006硕士

武汉大学

孙慧教授课题组

2006-2010博士

武汉大学

郭林教授课题组

2011-2013

香港大学

高级研究助理

2013-2018

武汉生物技术研究院

生物质谱平台负责人

2019-至今

水生所分测中心

蛋白质组学平台

主持：国家自然科学基金青年基金

湖北省博士后创新岗位基金

武汉市博士后科研启动基金

主要内容

➢蛋白质组学基本概念

➢蛋白质组学研究策略

蛋白质鉴定

定量蛋白质组学

➢靶向蛋白质组学

质谱领域的WB：MRMHR/PRM

蛋白质组学基本概念

蛋白质研究方法单个蛋白研究

大规模、高通量

蛋白质组学：大规模地研

究一个组织或物种中所有

传统方法VS蛋白质组学方法蛋白质的科学

蛋白质组学技术发展历程

LC-MS/MS实验经典流程

“Bottom-up”proteomicsor“Shotgun”proteomics

质谱扫描过程

蛋白质组学研究策略

➢蛋白质组学定性研究（MS2→肽段→蛋白）

@胶条鉴定、蛋白表达谱、修饰位点鉴定...

➢定量蛋白质组学（LFQ、TMT/iTRAQ、SWATH...）

@发现差异蛋白、相互作用组、PTM...

➢靶向蛋白质组学（MRMHR/PRM）

@质谱领域的WB

发现蛋白质组学(Discoveryproteomics)

蛋白质组学：从定性到定量

•定性：蛋白质鉴定、复合体鉴定、细胞内蛋白质组成、PTM...

•定量：比较不同状态下蛋白水平的变化