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顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为领头链(leadingstrand)。另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为随从链(laggingstrand)。复制中的不连续片段称为岡崎片段(okazakifragment)。领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性(semi-discontinuousReplication)。DNA复制的酶学和拓朴学变化TheEnzymologyandTopologyofDNAReplication第二节参与DNA复制的物质参与DNA复制的物质底物dNTP聚合酶DNA-pol模板解成单链的DNA母链引物与模板互补的RNA片段其它酶和蛋白质因子底物(substrate):dATP,dGTP,dCTP,dTTP聚合酶(polymerase):依赖DNA的DNA聚合酶简写为DNA-pol模板(template):解开成单链的DNA母链引物(primer):提供3?-OH末端使dNTP可以依次聚合解螺旋酶引物酶单链DNA结合蛋白DNA连接酶等复制的基本化学反应特点:需要引物和模板;新链的延长5?→3?方向PPiHOPPPG5′端3′端CGA聚合反应机理一、DNA聚合酶催化脱氧核苷酸之间聚合全称:依赖DNA的DNA聚合酶(DNA-dependentDNApolymerase)(DNA-directedDNApolymerase)缩写:DNA-pol活性:1.5??3?的聚合活性2.核酸外切酶活性DNA聚合酶接切1959年获诺贝尔生理学或医学奖奥乔亚科恩伯格SeveroOchoaArthurKornberg(一)原核生物有3种DNA聚合酶2个核心酶1个?-复合物(?、?、??、?、?、?6种亚基)1对?-亚基(可滑动的DNA夹子)DNA聚合酶Ⅲ全酶结构全酶结构包括:?亚基(130000)主要功能是合成DNA?亚基具有3??5?外切酶活性(复制保真性所必需)?亚基可增强其活性?亚基可能起组装作用核心酶由?、?和?亚基组成:两侧的β亚基发挥夹稳DNA模板链,并使酶沿模板滑动的作用2个?-亚基分别和1个核心酶相互作用,其柔性连接区可以确保在复制叉1个全酶分子的2个核心酶能够相对独立运动,分别负责合成前导链和后随链。功能:有促进全酶组装至模板上及增强核心酶活性的作用?-复合物由6种亚基组成:?、?、??、?、?、?小片段大片段/Klenow片段N端C端木瓜蛋白酶Klenow片段是实验室合成DNA,进行分子生物学研究中常用的工具酶。聚合酶NC小片段大片段(Klenow片段)3—5外切酶5—3外切酶DNA-polⅠ(109kD)DNA-polⅡ(120kD)DNA-polII基因发生突变,细菌依然能存活。DNA-polⅡ对模板的特异性不高,即使在已发生损伤的DNA模板上,它也能催化核苷酸聚合。因此认为,它参与DNA损伤的应急状态修复。真核生物和原核生物DNA聚合酶的比较E.Coli真核细胞功能Ⅰ填补复制中的DNA空隙,DNA修复和重组Ⅱ复制中的校对,DNA修复?DNA修复?线粒体DNA合成Ⅲ?错配修复?引物酶?前导链和后随链合成,错配修复2.酶在复制延长时对碱基的选择功能1.遵守严格的碱基配对规律3.复制出错时酶的及时校读功能DNA复制的保真性至少要依赖三种机制二、DNA聚合酶的碱基选择和校对功能实现复制的保真性三、复制中的解链伴有DNA分子拓扑学变化DNA分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把DNA解成单链后,它才能起模板作用。理顺DNA链拓扑异构酶(gyrA,B)稳定已解开的单链单链DNA结合蛋白SSB催化RNA引物生成引物酶DnaG(dnaG)运送和协同DnaBDnaC(dnaC)解开DNA双链解螺旋酶DnaB(dnaB)辨认起始点DnaA(dnaA)蛋白质(基因)通用名功能原核生物复制起始的相关蛋白质(一)多种酶参与DNA解链和稳定单链状态——利用ATP供能,在复制叉前解开一小段DNA1.解螺旋酶(he
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