基于肿瘤相关成纤维细胞基因构建乳腺癌预后预测模型及免疫浸润分析.pdfVIP

基于肿瘤相关成纤维细胞基因构建乳腺癌预后预测模型及免疫浸润分析.pdf

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生物技术进展2024年第14卷第2期312~322ဉ研究论文

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CurrentBiotechnologyISSN2095‑2341ဉ

基于肿瘤相关成纤维细胞基因构建乳腺癌预后预测模型及免

疫浸润分析

孙莉莉,安外尔·约麦尔阿卜拉,刘富中,布尔兰·叶尔肯别克,迪丽娜尔·叶尔夏提,

郭文佳*

新疆医科大学附属肿瘤医院,乌鲁木齐830011

摘要:乳腺癌的转移和恶性进展与肿瘤微环境密切相关。肿瘤相关成纤维细胞(cancerassociatedfibroblasts,CAFs)是

肿瘤微环境中比较重要的细胞,可影响肿瘤的进展及治疗。从基因表达综合数据库获得乳腺癌单细胞测序数据,对肿瘤

微环境细胞进行分簇,再利用WGCNA识别CAF相关的关键基因,用该基因在TCGA-BRCA数据库中构建风险评分模型,

进行生存分析、Cox回归分析、ROC曲线、构建列线图预测模型性能;通过GO和KEGG分析模型相关通路;利用体细胞突

变、免疫浸润分析、干性指数分析以及药物敏感性分析探讨风险评分与临床特征及肿瘤微环境的关系。研究构建了基于

10个CAF基因的乳腺癌预后预测模型,根据风险评分将患者分为高低风险组并进行验证,其中高风险组患者的预后更

差,列线图和ROC曲线也显示模型具有良好的预测效能,乳腺癌病人免疫浸润水平更低、干性指数更高,且高风险组病人

对紫杉醇及拉帕替尼这2种药物的敏感性更高。结果表明,10个CAF相关基因的风险评分可独立预测乳腺癌的预后及

治疗效果,为明确CAF相关基因在乳腺癌中的作用机制提供了思路,也为乳腺癌易感基因患者的临床个体化治疗提供了

理论依据。

关键词:乳腺癌;肿瘤相关成纤维细胞;肿瘤突变负荷;预后模型;免疫浸润

DOI:10.19586/j.2095­2341.2023.0161

中图分类号:Q75,R737.9文献标志码:A

ConstructionofPrognosticPredictionModelofBreastCancerBasedon

Tumor-associatedFibroblastGenesandAnalysisofImmuneInfiltration

SUNLili,ANWAIERYuemaierabola,LIUFuzhong,BUERLANYeerkenbieke,DILINAERYe,

GUOWenjia

*

AffiliatedCancerHospitalofXinjiangMedicalUniversity,Urumqi830011,China

Abstract:Metastasisandmalignantprogressionofbreastcanceraredeeplyrelatedtothetumormicroenvironment.Tumor-associ‐

atedfibroblasts(CAFs)

gressionandtreatment.Weobtainedsingle-cellsequencingdataofbreastcancerdownloadedfromgeneexpressionomnibusdata‐

base,clusteredthecellsoftumormicroenvironment,

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