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第七章蛋白质的生物合成-翻译
Chapter7proteinbiosynthesis(translation);一、遗传密码(geneticcodon);1954,Gamov提出三联体密码子;他们的方法是:
(1)去模板:用DNAase处理E.coli抽提物,使DNA降解,除去原有的细菌模板。
(2)加入polU:合成了多聚苯丙氨酸
这一结果不仅证实了无细胞系统的成功,同时还表明UUU是苯丙氨酸的密码子。
分别加入polyA,polyC和polyG结果相应地获得了多聚赖氨酸,多聚脯氨酸和多聚甘氨酸。;(3)按比例加入2种核苷混合的多聚物
由于当时还未分离RNApol酶,无法按设计的模板来合成RNA,Nirenberg又想出了一种新的方法,就是按一定的碱基比例来合成RNA。
比如在底物中加5份的UDP和1份的GDP,
碱基比为U:G=5:1,
它们能组成8种三联体:
UUU,UUG,UGU,GUU,
GGG,GGU,GUG,UGG。
U和G随机加入到三联体中,这样按比例各个位置上进入U和G的概率不同,如氨基酸测定结果:;如UUU:UGG=(5?5?5):(5?1?1)
=25:1
同理UUU:UUG=5:1,
根据检测结果推测:
苯丙氨酸(UUU):半胱氨酸(UGU)
=5:1
苯丙氨酸(UUU):缬氨酸(GUU)
=5:1
苯丙氨酸(UUU):甘氨酸(GGU)
=24:1
;核糖体结合实验;Date;以特定的共聚物为模板指导多肽的合成;Date;Ser丝氨酸;Thr苏氨酸;Tyr酪氨酸;Phe苯丙氨酸;起始密码(initiationcodon):AUG;遗传密码表;2、遗传密码的基本特征;(2)密码子的简并性;氨基酸密码子的简并性;(3)摆动性(wobble);密码子、反密码子配对的摆动现象;三中读二一般可分为三种情况:
(1)第1,2两个碱基形成6个氢键时,可三中读二。
如CCX,CGX,GCX和GGX。
(2)第1,2两个碱基形成4个氢键时,不可三中读二。
如AAX,AUX,UAX和UUX。
(3)第1,2两个碱基形成5个氢键时,
当第二个碱基为嘧啶时,可三中读二;
如UCX,ACX,CUX和GUX。
当第二个碱基为嘌呤时则不能三中读二,
如CAX,GAX,UGX和AGX。;密码子的使用频率与tRNA的数量有关;CodonusageObservedforE.coliRibosomeProtein;CodonusageinthegenesofAnimals;(5)通用性和变异性;Codon;二、tRNA;TψC常由5bp的茎和7nt的环组成,此臂负责和核糖体上的rRNA识别结合;
反密码子环(anticodonloop)常由5bp的茎区和7Nt的环区组成,它负责对密码子的识别与配对。
D环(Dloop)的茎区长度常为4bp,也称双氢尿嘧啶环。负责和氨基酰tRNA聚合酶结合;
额外环(extraloop)可变性大,从4Nt到21Nt不等,其功能是在tRNA的L型三维结构中负责连接两个区域(D环-反密码子环和TψC-受体臂)。;---aaacceptarm;
loadingaaat3’end;tRNA的三级结构示意图(倒L形);2、氨基酸活化;(2)氨基酰tRNA合成酶(aminoacyl-tRNAsynthetase,AARS);(3)氨酰tRNA合成酶的鉴别功能
动力学校对(Kineticproofreading)
化学校对(Chemicalproofreading);以aa为准校正tRNA;以tRNA为准校正aa;?
原核和真核生物核糖体的组成及功能
核糖体亚基rRNAs蛋白RNA的特异顺序和功能
细菌
70S50S23S=2904b31种(L1-L31)含CGAAC和GTψCG互补
2.5×106D5S=120b
66%RNA30S16S=1
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