第4章人工染色体载体ppt课件.pptxVIP

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第四章人工染色体载体

第一节粘粒载体

第二节酵母人工染色体载体

第三节细菌人工染色体载体

第四节P1噬菌体载体和P1人工染色体载体

本课件是在网络资源基础上改进而成，在此对有关人士特致感谢！

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常规载体在工作时都是在不影响质粒或噬菌体复制功能的基础上装载外源DNA片段的，同时保持质粒或噬菌体的基本特性。这样一来，这些载体所装载的容量就受到限制。利用染色体的复制元件来驱动外源DNA片段的载体称为人工染色体载体，其装载外源DNA片段的容量可以与染色体的大小媲美。

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第一节粘粒载体

一、粘粒的结构特征和用途

粘粒实际是质粒的衍生物，是带有cos序列的质粒。cos序列是噬菌体DNA中将DNA包装到噬菌体颗粒中所需的DNA序列。粘粒的组成包括质粒复制起点、抗性标记、cos位点，因而能像质粒一样转化和增殖。

它的大小一般5-7kb左右，用来克隆大片段DNA，克隆的最大DNA片段可达45kb。有的粘粒载体含有两个cos位点，在某种程度上可提高使用效率。

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二、粘粒载体的工作原理

粘粒载体的主要工作原理类似噬菌体载体。在外源片段与载体连接时，粘粒载体相当于噬菌体载体的左右臂，cos位点通过粘段退火后，再于外源片段相间连接成多联体。当多联体与噬菌体包装的蛋白质混合时噬菌体A基因蛋白的末端酶功能将切割成两个cos位点，并将两个同方cos位点之间的片段包装到噬菌体颗粒中去。

允许插入片段为30-45kb。

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三、粘粒克隆载体

粘粒pJB8、含双cos位点的粘粒载体、pcos1EMBL等。

四、粘粒载体文库的扩增和贮存

噬菌体颗粒状的粘粒文库在含有几滴氯仿的SM溶液中可以保存几周。

可以采用影印到硝酸纤维素膜上保存、挑取所有菌落混合培养后深冷保存，等。

五、粘粒载体文库的常见问题

载体分子自连，重组率降低

多个外源片段串联进入载体中

原料DNA片段短于200kb时，制备的目的DNA中相当一部分的末端的一端不带酶切位点

总DNA纯度影响目的DNA的制备

空载体现象

不同重组子的拷贝数不同

文库的代表性不足，缺泛一些目标基因。

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端粒重复序列：是定位于染色体末端的一段序列，用于保护线状DNA不被胞内的核酸酶降解，已形成稳定的结构。

着丝粒：是有丝分裂过程中纺锤丝的结合位点，使染色体在分裂过程中能正确分配到子细胞中。在YAC中起到保证一个细胞内只有一个人工染色体的作用。

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二、YAC载体的工作原理

YAC载体主要是用来构建大片段DNA文库，特别是用来构建高等真核生物的基因组文库，并不用作常规的基因克隆。图示是pYAC4载体的遗传结构图，当用BamHⅠ切割成现状后，就形成了一个微型酵母染色体，包含染色体复制的必要順式元件。这些元件在酵母菌中可以驱动染色体的复制和分配，从而决定着个微型染色体可以携带酵母染色体大小的DNA片段。

允许插入片段大小：没有限制，一般为250-400kb。

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YAC载体的原理性工作流程：

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对于BamHⅠ切割后形成的微型酵母染色体，当用EcoRⅠ或SmaⅠ切割抑制基因sup4内部的位点后形成染色体的两条臂，与外源大片段DNA在该切点相连就形成一个大型人工酵母染色体，转化到酵母菌后可像染色体一样复制，并随细胞分裂分配到子细胞中去，达到克隆大片段DNA的目的外源DNA片段的装载导致抑制基因sup4插入失活，从而使重组菌形成红色菌落；而载体自身连接转入到酵母细胞后所形成的菌落为白色。

YAC的缺点：插入片段容易出现缺失和重排现象，YAC与酵母染色体大小相似不容易分离和纯化。

YAC的优点：酵母细胞比大肠杆菌对不稳定的、重复的和极端的DNA片段有更强的容忍性，文库的代表性强，适合作真核染色体片段功能研究。

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第三节细菌人工染色体载体

细菌人工染色体载体（bacterialartificialchromosome，BAC）：就是基于大肠杆菌的F质粒构建的高容量低拷贝质粒载体。

F质粒：是一个约100kb的质粒，编码60多种参与复制、分配和结合过程的蛋白质。

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一、BAC载体及其结构组成

BAC载