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嘉积鸭较法国番鸭基因组特有SNP筛查及鉴定
摘要
为筛查出嘉积鸭全基因组特异SNP位点,阐述嘉积鸭SNP水平的品种特征,本文应用高通量基因组重测序技术,对比筛查嘉积鸭和番鸭特有的SNP位点,对嘉积鸭特异SNP对应的基因进行GO和KEGG功能富集分析,并随机选30个SNP位点和8个位点分别用SNaPshot和PCR验证,得到87%的真实可靠率,说明本研究中注释得到的SNP位点有一定的假阳性。研究结果共得到嘉积鸭特异SNP位点有4447923个,分布在20073个sanffold上,法国番鸭特异SNP位点有4416301个,分布在19750个sanffold上;GO和KEGG功能富集分析
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