生物信息学的生物学基础 (2).ppt

蛋白质蛋白质的结构蛋白质的二级结构（secondarystructure）二级结构主要有以下几种形式：（i）?螺旋（ii）?折叠–平行折叠反平行折叠（iii）?转角–连接作用”U”型结构（大多Phe,Gly组成）（iv）无规卷曲-没有确定规律性的肽链构象，但仍是紧密有序的稳定结构（v）无序结构多肽链中有６０％的区段为?螺旋和?折叠第31页,共61页，星期六，2024年，5月蛋白质蛋白质的结构?螺旋肽链主链骨架围绕中心轴盘旋成螺旋状的结构。第32页,共61页，星期六，2024年，5月蛋白质蛋白质的结构?折叠在多肽链之间或一条肽链的肽段之间靠氢键联结而成的锯齿状片层结构第33页,共61页，星期六，2024年，5月蛋白质蛋白质的结构?转角在球状的蛋白质分子中，肽链经常出现的回折，由4个连续的氨基酸组成。（大多Phe,Gly组成）第34页,共61页，星期六，2024年，5月蛋白质蛋白质的结构蛋白质的三级结构在二级结构基础上的肽链再折叠形成的构象α螺旋β折叠Zn疏水核心α螺旋第35页,共61页，星期六，2024年，5月蛋白质蛋白质的结构蛋白质的四级结构组成蛋白质的多条肽链在天然构象空间上的排列方式，多以弱键互相连接。疏水力、氢键、盐键第36页,共61页，星期六，2024年，5月第37页,共61页，星期六，2024年，5月蛋白质蛋白质结构与功能的关系一级结构即氨基酸顺序高级结构生物学功能（1）蛋白质一级结构与功能的关系 序列分析（2）蛋白质空间构象与功能的关系 结构分析第38页,共61页，星期六，2024年，5月细胞蛋白质核酸研究手段第39页,共61页，星期六，2024年，5月核酸核酸的化学结构碱基+戊糖 核苷+磷酸核苷酸 聚合核酸碱基戊糖磷酸第40页,共61页，星期六，2024年，5月符号含义说明GG鸟嘌呤AA腺嘌呤TT胸腺嘧啶CC胞嘧啶RGorA嘌呤YTorC嘧啶MAorC氨基KGorT酮基SGorC强氢键（3个氢键）WAorT弱氢键（2个氢键）HAorCorT非GBGorTorC非AVGorCorA非T(非U)DGorAorT非CNGorAorTorC任意碱基扩展的遗传学字母表或IUPAC编码第41页,共61页，星期六，2024年，5月核酸DNA的一级结构（1）DNA的碱基组成（i）A=T,G=C（ii）A+G=C+T（2）DNA的一级结构由A、T、C、G四种脱氧核苷酸通过3‘、5’-磷酸二酯键连接而成的长链高分子多聚体为DNA分子的一级结构第42页,共61页，星期六，2024年，5月核酸RNA和核糖体RNA是单链分子,RNA主要有三种:信使RNA（mRNA）-转录遗传信息核糖体RNA（rRNA）-蛋白质合成转运RNA（tRNA）-转运氨基酸核糖体是蛋白质合成的场所，核糖体主要由蛋白质分子和rRNA组成第43页,共61页，星期六，2024年，5月核酸RNA和核糖体反密码子氨基酸新生肽链核糖体mRNAmRNA，tRNA，rRNAtRNA16SrRNA可识别mRNA起始位点第44页,共61页，星期六，2024年，5月核酸遗传密码的基本特征密码无标点符号密码的简并性（degeneracy）特殊密码子第45页,共61页，星期六，2024年，5月核酸中心法则复制DNA转录逆转录复制RNA蛋白质翻译调控第46页,共61页，星期六，2024年，5月核酸基因基因具有几个重要的特征：基因是一种相对独立的遗传信息单位；基因是一段DNA分子，遗传信息贮存在DNA中；基因通过指