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#源代码#用R语言对表达谱样本做PCA分析

暗香疏影

主成分分析（Principalcomponentanalysis,PCA）是一种数学算法，它可以在减少数

据维度的同时，保留数据集中绝大多数的变量[1]。PCA通过对主成分进行辨别，找出一

个方向，并沿此方向分布的数据为最大值，从而减少数据维度。通过采用这样的主成分，

便可以只选用若干变量而不是上千的变量来对一种样品进行分析了。这样，就可以将样

品有关变量绘制成图，使得样品间的相似性和相异之处一目了然，对不同样品是否可以

归为一组，也一清二楚。这里我们主要解析如何利用R语言，基于表达谱中的表达

值做PCA分析，并输出三维的PCA结果图。

1.安装并加载rgl包

source()

biocLite(“rgl”)

library(rgl)

2.输入