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海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。——林则徐
图解DNA测序技术的原理与操作
DNA测序技术是一种快速准确地测定DNA序列的方法,它可
以应用于基础研究、医学诊断、辅助决策等领域。DNA测序技术
的原理是通过测量DNA碱基之间的化学键来确定其序列。
DNA测序的发展历程
DNA测序技术在20世纪中期开始发展。当时,科学家们利用
毒蕈碱和亚硝酸钠等化学试剂将DNA分解成单个核苷酸分子,然
后通过电泳将分子按照大小分开。通过观察电泳结果,科学家们
得以确定碱基序列。
20世纪70年代末,Sanger发明了dideoxy法,使得测序技术得
到了重大的进展。dideoxy法以单链DNA为模板,在该模板上合
成一系列新的DNA片段。这些新的DNA片段不同于模板,因为
它们以特定的方式截止于dideoxynucleotide。这些
dideoxynucleotide是无法延伸的,因此一旦它们被合成到了新的
DNA片段中,该片段合成就截止了。这种方法可以验证DNA序
列,并且可以在大规模基因组测序任务中运用。
海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。——林则徐
现代DNA测序技术
现代DNA测序技术有多种,包括Illumina、IonTorrent、
PacBio和Nanopore等。其中,Illumina是目前最广泛应用的测序
技术之一。
Illumina测序技术
Illumina使用悬浮在小珠子上的(End-Bound)DNAs浓缩在测
试管中。在静止的状况下,铺设在黄色胶片上的DNA接头被拉伸,
并用荧光标记的ddNTP来扩展从已接头的DNA的3端到最近发
出的碱基。这种延长作用结合了测序信号和序列测量。处理过的
簇可以被移动到一个新的位置上,这样就可以在具有更高的通量
和更高的密度下进行处理。Illumina紧凑的读片机设计可容纳数以
千亿的簇,因此即便少量的DNA也可以实现高通量测序。
DNA测序技术的操作步骤
DNA测序的一般操作步骤包括:样品制备、文库构建、测序准
备、碱基测序、数据解读和结果分析等。具体步骤如下:
海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。——林则徐
样品制备:将待检测样品提取DNA,并在PCR扩增过程中对
DNA进行分离和纯化,以使其达到测序指标。
文库构建:将DNA文库进行构建,包括DNA片段剪切、双端
连接、PCR扩增和文库纯化。
测序准备:将文库DNA片段按照特定的方式连接到测序仪上,
准备好反应体系。
碱基测序:通过读取同一文库DNA样品的同一个片段,测定
DNA中多个碱基的序列,从而得到碱基序列信息。
数据解读和结果分析:对得到的碱基序列信息进行比对和分析,
找出不同样品之间的共同点和差异点,并得出结论和判断。
总结
DNA测序技术的成熟与发展为我们带来了无限的可能,但也带
来了挑战。正确的DNA序列测定和解读,需要熟练的技能和丰富
海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。——林则徐
的经验。然而,技术的不断发展以及算法分析软件的日益成熟,
将使得DNA测序技术的应用领域越来越广泛,也将大大推动基因
组学研究的发展和进步。
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