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第04章-蛋白质的共价结构ppt课件.pptxVIP

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第三节蛋白质的共价结构(一级结构);基本要求

1.肽的结构特点、基本性质

2.蛋白质一级结构测定方法

3.一级结构与生物功能关系,有关典型例子;;一肽与肽键的结构:

氨基酸残基(aminoacidresidues)

肽链的极性

N-端(左)、C-端(右)

多肽链的一端含有一个游离的?-氨基,称为氨基端或N-端。另一端含有一个游离的?-羧基,称为羧基端或C-端。

氨基酸序列是从N-端的氨基酸残基开始,以C-端氨基酸残基为终点的排列顺序。

肽基(peptidegroup):也称肽单位,肽链中的酰氨基(-CO-NH-);(酰氨键)

肽键:AA间脱水后形成的共价键;;;;肽平面示意图;肽平面:也称肽基平面、酰胺平面。

肽键的平面性质在肽链折叠成三维结构中是很重要的。;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(三)天然存在的活性肽;(三)天然存在的活性肽;GSH(还原型)

三肽;Glu-?-Cys-Gly

|

S

|

S

|

Glu-?-Cys-Gly;生理功能;L-Aspartyl-L-phenylalaninemethylester;+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO-Met-脑啡肽

+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO-Leu-脑啡肽;抗革兰氏阳性菌

治疗化脓性病症;蛋白质

氨基酸残基数在50个以上,具有特定空间结构的肽。

多肽

氨基酸残基数在50个以下,无特定空间结构的肽。;三、蛋白质一级结构的测定;二硫键的数目和位置;1测定多肽链的数目;准备工作(一):

样品的分离纯化和纯度鉴定纯度>97%

检测蛋白质样品纯度的方法:

(1)电泳

(2)层析

(3)N-末端氨基酸的测定

(4)等电点沉淀

(5)纯化至恒定的比活;准备工作(二):

确定相对分子量误差10%

(1)凝胶过滤

(2)沉降分析法

(3)SDS(SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳);测定要求;1、测定蛋白质分子中多肽链的数目

测定末端AA的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系

确定多肽链的数目

;2、多肽链的拆分

多条多肽链组成的蛋白质分子,必须拆分;2.多肽链的拆离P171

1).亚基拆分:

①PH改变:PH10;PH3

②强变性剂:脲(8M);盐酸胍(6M)

③高浓盐

2).二硫键拆??

氧化:过甲酸,不再重新生成-S-S-

还原:DTT;巯基乙醇→加碘乙酸等烷基化试剂→封闭SH

烷基化试剂:碘乙酸,碘乙酰胺,环乙烯亚胺

3).肽链分离和鉴定

分离:层析电泳

鉴定:SDS;N-末端分析;寡聚蛋白质:多肽链以非共价键连接

血红蛋白(四聚体)、烯醇化酶(二聚体)

8mol/L尿素

6mol/L盐酸胍;2)二硫键的断裂

几条多肽链通过二硫键交联

8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下

过量的?-巯基乙醇处理

二硫键还原为巯基

烷基化试剂保护巯基,防止重氧化;;

;3.肽链aa组成的测定:

1)蛋白水解:

酸解法;碱解法;

5.7N恒沸HCL①Trp100%被破坏

酸解:Pr溶液105-110℃20-72h②二硫键解离

③AsnGln→AspGlu

④SerThrTyrLys部分破坏

2)aa定性和定量:

定性:纸层析;薄层层析;高压纸电泳

定量:柱层析(离子交换原理);3、测定各多肽链的AA组成

并计算出氨基酸成分的分子比;4、分析多肽链的N-末端和C-末端;末端氨基酸:N-端A(amino-terminal)、C-端AA

最重要的是N-端AA分析法;?二硝基氟苯(DNFB)法;丹磺酰氯与N-端AA的游离氨基作用,丹磺酰-AA

优点:丹磺酰-AA强荧光,检测灵敏度达10-9mol;C-端AA分析法

多肽与肼在无水条件下加

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