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第三节蛋白质的共价结构(一级结构);基本要求
1.肽的结构特点、基本性质
2.蛋白质一级结构测定方法
3.一级结构与生物功能关系,有关典型例子;;一肽与肽键的结构:
氨基酸残基(aminoacidresidues)
肽链的极性
N-端(左)、C-端(右)
多肽链的一端含有一个游离的?-氨基,称为氨基端或N-端。另一端含有一个游离的?-羧基,称为羧基端或C-端。
氨基酸序列是从N-端的氨基酸残基开始,以C-端氨基酸残基为终点的排列顺序。
肽基(peptidegroup):也称肽单位,肽链中的酰氨基(-CO-NH-);(酰氨键)
肽键:AA间脱水后形成的共价键;;;;肽平面示意图;肽平面:也称肽基平面、酰胺平面。
肽键的平面性质在肽链折叠成三维结构中是很重要的。;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(二)肽的理化性质;(三)天然存在的活性肽;(三)天然存在的活性肽;GSH(还原型)
三肽;Glu-?-Cys-Gly
|
S
|
S
|
Glu-?-Cys-Gly;生理功能;L-Aspartyl-L-phenylalaninemethylester;+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO-Met-脑啡肽
+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO-Leu-脑啡肽;抗革兰氏阳性菌
治疗化脓性病症;蛋白质
氨基酸残基数在50个以上,具有特定空间结构的肽。
多肽
氨基酸残基数在50个以下,无特定空间结构的肽。;三、蛋白质一级结构的测定;二硫键的数目和位置;1测定多肽链的数目;准备工作(一):
样品的分离纯化和纯度鉴定纯度>97%
检测蛋白质样品纯度的方法:
(1)电泳
(2)层析
(3)N-末端氨基酸的测定
(4)等电点沉淀
(5)纯化至恒定的比活;准备工作(二):
确定相对分子量误差10%
(1)凝胶过滤
(2)沉降分析法
(3)SDS(SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳);测定要求;1、测定蛋白质分子中多肽链的数目
测定末端AA的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系
确定多肽链的数目
;2、多肽链的拆分
多条多肽链组成的蛋白质分子,必须拆分;2.多肽链的拆离P171
1).亚基拆分:
①PH改变:PH10;PH3
②强变性剂:脲(8M);盐酸胍(6M)
③高浓盐
2).二硫键拆??
氧化:过甲酸,不再重新生成-S-S-
还原:DTT;巯基乙醇→加碘乙酸等烷基化试剂→封闭SH
烷基化试剂:碘乙酸,碘乙酰胺,环乙烯亚胺
3).肽链分离和鉴定
分离:层析电泳
鉴定:SDS;N-末端分析;寡聚蛋白质:多肽链以非共价键连接
血红蛋白(四聚体)、烯醇化酶(二聚体)
8mol/L尿素
6mol/L盐酸胍;2)二硫键的断裂
几条多肽链通过二硫键交联
8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下
过量的?-巯基乙醇处理
二硫键还原为巯基
烷基化试剂保护巯基,防止重氧化;;
;3.肽链aa组成的测定:
1)蛋白水解:
酸解法;碱解法;
5.7N恒沸HCL①Trp100%被破坏
酸解:Pr溶液105-110℃20-72h②二硫键解离
③AsnGln→AspGlu
④SerThrTyrLys部分破坏
2)aa定性和定量:
定性:纸层析;薄层层析;高压纸电泳
定量:柱层析(离子交换原理);3、测定各多肽链的AA组成
并计算出氨基酸成分的分子比;4、分析多肽链的N-末端和C-末端;末端氨基酸:N-端A(amino-terminal)、C-端AA
最重要的是N-端AA分析法;?二硝基氟苯(DNFB)法;丹磺酰氯与N-端AA的游离氨基作用,丹磺酰-AA
优点:丹磺酰-AA强荧光,检测灵敏度达10-9mol;C-端AA分析法
多肽与肼在无水条件下加
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