2025年以蛋白质组学研究病原微生物感染过程-有机化学论文-化学论文.pdfVIP

学而不知道，与不学同；知而不能行，与不知同。——黄睎

以蛋白质组学研究病原微生物感染过程-有

机化学论文-化学论文

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1背景介绍

······················[1].2025

年，PatrickOFarrell使用二维聚丙烯酰胺凝胶电泳（2D）对大

肠杆菌（Escherichiacoli）蛋白进行分离，得到超过1000个凝胶点，

标志着人类第一次实现了对生物体全部蛋白进行系统层次的分离[2].

随着基因组学的发展和人类基因组计划的进行，蛋白质组（proteome）

这一概念最早于1996年被提出[3],指一个细胞或生物体内全部的蛋

白质；分析蛋白质组的学科则被称为蛋白质组学（proteomics）[4].

蛋白质是生命活动的执行者，一切基因和转录层次的变化，最终都要

在蛋白质的层次（如表达量和翻译后修饰）发生变化才能表现出其生

命意义。因此，蛋白质组学一直受到生命科学研究者的广泛关注。

先天下之忧而忧，后天下之乐而乐。——范仲淹

在基质辅助激光解吸（matrixassistedlaserdesorption

ionization,MALDI）和电喷雾（electrosprayionization,ESI）这两种可电

离多肽和蛋白质的离子化技术产生后，基于质谱的蛋白质组学（mass

spectrome-try-basedproteomics）得到了快速发展[5-6].多肽和蛋白质

离子在一定的激发条件如碰撞导解离（colli-sioninduced

dissociation,CID）或电子俘获解离（electroncapturedissociation,ECD）

等作用下，产生在肽链骨架上的断裂，即可通过多肽/蛋白质的多级

质谱得到其结构信息。与传统分析化学和生物化学鉴定蛋白采用的氮

端测序和免疫印迹等方法相比，基于质谱的蛋白质组学拥有分析速度

快、样品用量小、序列覆盖率高、定量手段成熟、易于分析翻译后修

饰等众多优点。因此，基于质谱的蛋白质组学成为当前蛋白质组学领

域最主要也是发展最快的方法。

与高等真核生物的蛋白组相比，原核生物编码的蛋白质数量

少得多，蛋白的复杂性（如RNA剪切造成的一个基因对应多个蛋白）

也远远小于高等真核生物。从分析化学的角度来说，体系的复杂度相

对较小，因此以原核生物及其他微生物作为模型体系的蛋白质组学相

对发展较快。在研究微生物的蛋白质组学时，一个具有重要科学意义

的问题是病原微生物和与感染（infection）相关的蛋白质组学。世界

百川东到海，何时复西归?少壮不努力，老大徒伤悲。——汉乐府

卫生组织的统计数据表明，病原微生物引发的传染病造成的占2011

年全部原因的1/3,因此对病原微生物感染过程的研究也具有极其重

要和迫切的现实意义。在病原微生物入侵和感染宿主以及宿主拮抗病

原微生物感染的过程中，执行关键生命活动的蛋白质究竟有哪些?它

们是如何发挥生命作用的?这些问题都只有在蛋白质层次进行研究

才能得到最终的解答。通过对这些重要生命过程分子机制的理解，人

们将对病原微生物-宿主相互作用的过程有更加深入的认识，从而为

设计抗感染的药物以及抑制病原微生物引发的传染病提供思路。

学术期刊Proteomics在2011年已出版了关于微生物蛋白

质组学的专刊[7],其部分工作与病原微生物有关。本文将从病原微生