水稻品种KHAO KAI抗褐飞虱遗传分析及抗灰飞虱位点全基因组关联分析.pdfVIP

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摘要I

ABSTRACTIII

缩略词VII

第一章文献综述1

1水稻褐飞虱概况和抗褐飞虱遗传基础研究1

1.1褐飞虱的危害1

1.2褐飞虱的生物学和生态学特征及生物型2

1.3水稻抗褐飞虱鉴定3

1.4水稻抗褐飞虱基因的定位与克隆4

2水稻灰飞虱概况和抗灰飞虱遗传基础研究7

2.1灰飞虱的形态9

2.2灰飞虱的生活习性11

2.3寄主植物12

2.4灰飞虱的危害12

2.5灰飞虱的爆发原因与防治措施13

2.6水稻抗灰飞虱基因的定位13

3全基因组关联分析研究现状18

3.1全基因组关联分析原理19

3.2模型选择和软件选择21

3.3全基因组关联分析的应用22

4本研究的目的和意义23

第二章水稻KHAOKAI抗褐飞虱遗传分析及QTL定位25

1材料与方法25

1.1供试材料25

1.2褐飞虱虫源25

1.3抗性鉴定及抗性等级评价26

1.4DNACTAB26

植物总制备（法）

1.5KASP标记和基因分型26

1.6数据统计27

i

水稻品种KHAOKAI抗褐飞虱遗传分析及抗灰飞虱位点全基因组关联分析

1.7遗传图谱的构建和QTL检测27

2结果与分析28

2.1抗褐飞虱种质资源的筛选28

2.2KHAOKAI/02428的F群体抗褐飞虱表型鉴定29

23

：

2.3BCF群体全基因组遗传图谱构建30

12:3

2.4抗褐飞虱QTL的检测31

3讨论32

第三章抗灰飞虱位点全基因组关联分析35

1材料与方法35

1.1供试材料35

1.2灰飞虱虫源35

1.3抗性鉴定方法与表型统计36

1.4标记SNP分型36

1.5全基因组关联分析36

1.6候选基因单倍型分析37

1.7引物设计与合成37

1.8转基因载体构建37

2结果与分析37

2.1282份水稻品种资源抗灰飞虱表型分析37

2.2分子数据群体结构分析35

2.3全基因关联分析39

2.4区间内各基因情况40

2.5候选基因单倍型分析41

2.6转基因实验46

3讨论46

第四章全文小结49

1全文结论49

2本研究的创新之处49

3本研究的不足之处49

参考文献51

附录57

致谢67

ii

摘要

水稻品种KHAOKAI抗褐飞虱遗传分析及抗灰飞虱

位点全基因组关联分析

摘要

水稻（O