水稻种子活力相关基因qSV3的克隆与功能分析.pdfVIP

目录

摘要I

ABSTRACTV

缩略词英汉对照表IX

第一部分文献综述1

第一章水稻种子活力相关基因克隆与调控机理研究进展1

1.种子活力1

1.1种子活力概念1

1.2种子活力的影响因素1

1.3种子活力评价指标3

1.4水稻高活力种子的生产意义3

2.水稻种子活力相关基因定位与挖掘4

2.1水稻种子活力相关基因定位4

2.2水稻种子活力相关基因克隆6

3.水稻种子活力调控的分子机制9

3.1激素调控9

3.2转录因子调控16

3.3microRNAs调控17

3.4表观基因组调控18

3.5ROS调控21

3.6其他因素调控22

第二章HIP蛋白功能研究进展25

1.HIP蛋白发现25

2.HIP蛋白结构25

3.HIP蛋白研究进展27

4.本研究的目的、意义及内容28

第二部分研究报告31

第三章水稻种子萌发相关基因qSV3的定位与克隆31

1.材料与方法32

1.1植物材料与生长条件32

1.2试验菌株和载体32

1.3种子活力鉴定33

1.4水稻基因组DNA提取33

1.5分子标记开发与亲本多态性筛选34

1.6qSV3精细定位与候选基因序列分析35

1.7总RNA提取及cDNA第一链的合成36

1.8载体构建37

1.9基因表达分析40

1.10生物信息学分析40

1.11数据分析41

2.结果与分析41

2.1种子活力相关性状的QTL定位41

2.2基于F2分离群体qSV3位点遗传验证42

2.3近等基因系种子萌发表型44

2.4qSV3精细定位46

2.5qSV3候选基因在双亲间序列比较48

2.6qSV3候选基因表达分析49

2.7OsHIPL1蛋白的理化性质分析和结构预测51

2.8OsHIPL1系统进化分析52

2.9OsHIPL1转基因材料种子萌发表型验证53

3.讨论58

3.1种子活力评价指标58

3.2CSSL群体种子活力位点分析59

3.3水稻种子活力位点比较分析59

3.4OsHIPL1为qSV3位点的目标基因60

第四章水稻种子活力关键基因OsHIPL1的功能解析63

1.材料与方法64

1.1植物材料与种植方式64

1.2种子发芽表型鉴定64

1.3试验菌株和载体65

1.4OsHIPL1蛋白亚细胞定位65

1.5酵母双杂交文库筛选67

1.6双分子荧光互补实验69

1.7荧光素酶互补实验70

1.8种子总RNA提取及cDNA第一条链合成70

1.9基因表达分析71

1.10转录组分析72

1.11激素含量测定方法73

1.12种子萌发过程中吸水速率的测定73

1.13单倍型分析73

1.14数据分析73

2.结果分析73

2.1OsHIPL1组织表达特征73

2.2OsHIPL1亚细胞定位分析75

2.3转录组分析76

2.4OsHIPL1降低水稻种子萌发过程中ABA含量81

2.5OsHIPL