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酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理
酚氯仿法提取DNA是一种常用的分子生物学技术。
一、主要步骤
样品准备:
对于动物组织,通常需要先将其放在离心管中,用酒精和纯水进行梯度脱酒精处理,然后研磨并加入DNA裂解液。
对于其他类型的样品(如植物组织、细菌、病毒等),则需要根据其特性进行适当的预处理。
加入蛋白酶K和裂解液:
将研磨好的组织液加入离心管中,并加入适量的蛋白酶K和DNA裂解液。
蛋白酶K能够水解蛋白质,使其与DNA分离。
裂解液则有助于破坏细胞膜和核膜,释放DNA。
加入酚氯仿混合物:
向离心管中加入等体积的酚氯仿混合物(通常酚:氯仿:异戊醇的比例为25:24:1)。
酚和氯仿都是有机溶剂,它们能够破坏细胞膜和核膜,并沉淀蛋白质。
异戊醇则有助于减少抽提过程中的泡沫产生,并有助于分相。
离心与分层:
将离心管置于离心机中,以适当的转速(如12000R或16000×g)离心数分钟(如5~7分钟)。
离心后,混合物将分成三层:上层为DNA所在的水相,中层为蛋白质层,下层为有机溶剂层。
吸取上层水相:
小心吸取上层水相,并将其转移至新的离心管中。
确保在吸取过程中不携带任何有机相或蛋白质层。
沉淀DNA:
向水相中加入适量的盐(如醋酸钠)和冷乙醇(通常是2倍体积的预冷无水乙醇或-20℃冷冻的100%酒精)。
盐能够中和DNA分子上的负电荷,使其易于沉淀。
乙醇则能够夺去DNA周围的水分子,使其失水而易于聚合。
离心与洗涤:
将离心管置于离心机中,以适当的转速离心数分钟。
离心后,弃去上清液,留下白色沉淀(DNA)。
用70%的乙醇洗涤DNA沉淀,以去除盐分和其他溶剂残留。
溶解DNA:
将洗涤后的DNA沉淀置于室温下挥发至干。
加入适量的蒸馏水或生理盐水溶解DNA沉淀。
二、原理
酚氯仿法提取DNA的原理主要基于以下几点:
有机溶剂的作用:
酚和氯仿作为有机溶剂,能够破坏细胞膜和核膜,使DNA释放到溶液中。
同时,它们还能够沉淀蛋白质,从而实现DNA与蛋白质的分离。
蛋白质变性:
酚能够使蛋白质变性,并抑制DNase的降解作用。
变性后的蛋白质与DNA的联结键断裂,蛋白分子溶于酚相,而DNA则溶于水相。
DNA的溶解性:
DNA分子具有水溶性,因此在酚氯仿抽提过程中会进入水溶液层。
通过加入盐和乙醇等试剂,可以进一步沉淀和纯化DNA。
分相与离心:
异戊醇的加入有助于减少抽提过程中的泡沫产生,并有助于分相。
通过离心作用,可以将混合物分成三层,从而方便地分离出DNA所在的水相。
酚氯仿法提取DNA是一种简单而有效的分子生物学技术,其原理基于有机溶剂对细胞膜和核膜的破坏作用、蛋白质的变性作用、DNA的溶解性以及分相与离心等步骤。
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