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转座元件在植物生长发育中的作用--第1页
转座元件在植物生长发育中的作用
王姗姗
【摘要】转座元件依据转座机制通常分为反转座子和DNA转座子2类.将关于反
转座子、DNA转座子对于基因表达和植物生长发育的影响的研究进行总结,发现转
座元件主要通过以下4种方式影响基因表达:第一,通过插入基因内部,破坏基因的完
整结构从而使基因失活,如插入到基因的外显子、内含子及5ˊUTR区;第二,通过插
入到基因的调控区而影响基因的表达水平,包括插入到基因的启动子、增强子、衰
减子区,或为基因表达提供新的启动子或cis作用位点作为增强子;第三,通过一系列
表观遗传机制影响基因的表达,如DNA甲基化及SiRNA;第四,通过染色体重组、基
因复制、基因丢失等机制影响基因的拷贝数及表达水平,甚至产生新的基因.
【期刊名称】《现代农业科技》
【年(卷),期】2017(000)009
【总页数】5页(P142-146)
【关键词】转座元件;基因表达;表型;植物生长发育
【作者】王姗姗
【作者单位】西藏自治区农牧科学院农业研究所,西藏拉萨850000
【正文语种】中文
【中图分类】Q943.2
转座元件(Transposableelements)依据其转座机制主要可以分为反转座子
(ClassⅠ)、DNA转座子(ClassⅡ),是在大部分真核生物中都广泛存在、含
转座元件在植物生长发育中的作用--第1页
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量丰富的可移动DNA序列,曾一度被认为是“垃圾DNA”,但现代研究表明转
座元件对于基因和基因组进化具有重要影响,是物种进化的重要推动力[1-2]。转
座元件作为基因组的重要组成部分,同样是目前为止植物基因组中的最大可动部分,
其数量的或扩张或缩减的波动,可造成甚至是相近物种基因组组成的显著不同,而
转座元件的激活同样也可造成基因表达和功能的系列变化,这些基因或与植物的生
殖生长相关,或与植物的胁迫应答相关[3]。
反转座子通过RNA介导的“复制-粘贴”机制实现转座,这类转座子通过RNA聚
合酶Ⅱ将转座元件转录为mRNA,再经由反转录酶反转录为cDNA,最后通过整
合酶(INT)插入到基因组中的新位点,产生新的拷贝[4]。反转座子包含LTR反
转座子和非LTR反转座子,其中LTR反转座子具有Copia和Gypsy2等2个亚族,
而非LTR反转座子则主要包括长散在元件(LINEs)和短散在元件(SINEs)[5]。
反转座子的转座激活,不单可以产生新的拷贝,对基因组的扩张有重要意义,而且
可以通过系列遗传或表观遗传机制影响到临近基因的表达。
1.1反转座子引起基因失活
反转座子造成的表型改变最基础、最简单的类型就是通过破坏原有的基因表达。在
大豆中,2个同源基因GmphyA1和GmphyA2可以编码光敏色素A,对植物的
光周期敏感性具有重要作用。在光周期非敏感的株系中,GmphyA2基因由于一
个Copia类反转座子SORE-1到第1个外显子中导致其失活。SORE-1同
Sto-4、BARE-1、RIRE1具有序列同源性,具有转录活性,并且其转录活性受表
观遗传机制所抑制。SORE-1在大豆基因组中具有同源序列,但大部分处于沉默状
态[6]。高分子量谷蛋白的含量同面粉的加工品质息息相关,经研究发现编码高分
子谷蛋白亚基(HMW-GS)的Glue-1
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