现代化学前沿讲座.ppt

体系数据和性质的综合分析分子(材料)CAD合成路线CAD化学CAI数据采集、统计分析及其它应用化学数据库量子化学计算计算机分子模拟分子结构建模与图象显示化学人工智能分子力学(MM)分子动力学(MDMC)计算机化学计算机化学的主要内容化学数据库（Database）化学人工智能（需借助数据库）分子结构库晶体库热力学数据库药物库高分子库分子光谱、波谱图谱库生物数据库（蛋白质、核酸、多糖库）化学文献库计算机辅助分子结构解释化学模式识别结构－活性关系分析(QSAR)结构－性质关系分析(QSPR)神经网络算法与神经网络计算机结构建模?确定各原子的初始空间排布? 这是用计算机处理分子大多数作业的起点? 综合的计算机化学软件包，主程序应提供 建模的友好界面，同时具有分子图形显示 与结构参数分析功能? 可采用二维或三维建模。程序可自动将二 维图形转换为三维分子结构建模与图形显示分子的计算机模拟MolecularModeling(AtomicSimulation)WhatisMolecularModeling?用计算机模拟化学体系的微观结构和运动，并用数值运算、统计求和方法对系统的平衡热力学、动力学、非平衡输运等性质进行理论预测分子模拟是化学CAD的重要部分什么是分子计算机模拟?1宏观化学现象是~1024个分子（原子）的集体行为，固有统计属性2化学统计力学的局限性：通常仅适用于“理想体系”?理想气体、完美晶体、稀溶液等3量子力学方法的局限性：对象为平衡态、单分子或几个分子组成的体系；不适用于动力学过程和有温度压力变化的体系为何进行分子计算机模拟?甘氨酸(glycine)在真空中的MD模拟T=300K，Timestep?t=0.0012ps甘氨酸稀水溶液的MD模拟T=300K，Timestep?t=0.0010ps甘氨酸的两种MD模拟结果MARI0071.AVI现代化学前沿问题讲座二十世纪八十年代以来，先进的分析仪器的应用、量子化学计算方法的进展和计算机技术的飞速发展，对化学科学的发展产生了冲击性的影响。其研究内容、方法、乃至学科的结构和性质都在发生深刻的变化。长期以来，化学一直被科学界公认为一门纯实验科学。其理由要追溯到人类认识自然的两种科学方法。⑴ 归纳法(F.Bacon,1561-1626)⑵ 演绎法(R.Decartes,1596-1650)设计实验实验数据唯象理论“预测”数据拟合检验公理假设形式理论 二次形式化、近似、计算和模拟预测模型实验检验01迄80年代，归纳法是多数化学家采用的唯一科学方法；演绎法在化学界从未得到普遍承认原因：①对象复杂；②习惯观念02归纳法(Reduction)与演绎法(Deduction)的比较马克思运用数学的多少是一门科学成熟的程度的标志。数学的应用：在刚体力学中是绝对的，在气体力学中是近似的，在液体力学中就已经比较困难了；在物理学中是试验性的和相对的；在化学中是最简单的一次方程式；在生物学中等于零。恩格斯12恩格斯的论断反映了19世纪中叶自然科学各学科的“成熟程度”。表明各学科研究对象?物质运动形式与规律?其复杂程度的差异然而，百年来科技的发展使各学科的“成熟程度”发生了巨大变化无机、有机化学在19世纪率先建立冶金、建材工业推动了无机药物、染料、酿酒工业推动了有机物理化学在20世纪初形成。旨在揭示化学反应的普遍规律—反应进行的方向、程度和速度…Gibbs?化学热力学Gibbs自由能：G=H?TS反应速率常数：Arrhenius?化学动力学010203物理化学的建立使化学科学开始拥有了理论。高等数学首次派上了用场—虽然仅是一阶的常、偏微分方程而已（以后在经典统计热力学中用到了概率论）经典物理化学的理论是唯象的，是有限的地球空间内宏观化学反应规律的经验总结30年代量子化学和量子统计力学分支的形成使化学科学开始与演绎法“沾上了边”。但在80年代前进展十分缓慢Einstein广义和狭义相对论（1905）量子力学的创建（1925~1926）对廿世纪人类科技和物质文明进步产生巨大影响。其中，量子力学的影响更为直接和广泛。20纪初理论物理两项重大突破量子力学是演绎法最成功的实例量子力学的建立未依据任何实验事实或经验规律。它用少数几条基本假定作为公理，由此出发，通过严格的逻辑演绎，迅速地建成一个自洽、完备、