基于PacBio平台的番红花多柱头突变体全长转录组分析.docxVIP

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2025-02-20 发布于广东
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基于PacBio平台的番红花多柱头突变体全长转录组分析.docx

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基于PacBio平台的番红花多柱头突变体全长转录组分析

基于PacBio平台的番红花多柱头突变体全长转录组分析（1）．．．．．．3

一、研究背景与目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

番红花的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

多柱头突变体的研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

PacBio平台在转录组分析中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

二、实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

（1）番红花多柱头突变体．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

（2）PacBio测序平台简介及试剂材料选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

（1）转录组测序流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

（2）数据处理与分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

三、结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

测序数据概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

（1）数据总量及质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

（2）数据预处理结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

转录组特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

（1）基因表达水平分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

（2）基因结构变异分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

（3）转录因子及代谢途径分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

多柱头突变体特异性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

（1）差异表达基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

（2）突变体特异性基因功能分析注释及来源识别．．．．．．．．．．．．．．．24

基于PacBio平台的番红花多柱头突变体全长转录组分析（2）．．．．．24

一、内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

二、实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

（一）番红花多柱头突变体．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

（二）PacBio平台简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

三、结果与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

（一）全长转录组测序结果概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

（二）差异表达基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

（三）突变体相关基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

（四）讨论部分．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

结果分析的意义与重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

与其他研究的对比与联系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

研究中的局限性及未来研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

四、番红花多柱头突变体相关基因的功能研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

（一）基因功能研究背景及目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

（二）基因功能研究方法与流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

（三）基因

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