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转录组与小RNA测序：草类性状联合分析新视角
目录
转录组与小RNA测序：草类性状联合分析新视角（1）．．．．．．．．．．．．．．4
一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1转录组与小RNA测序技术的发展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2草类性状研究的现状与挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.3研究的重要性及预期目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
二、研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1研究材料的选择与收集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.2转录组测序技术流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.3小RNA测序技术流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.4数据处理与分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
2.5联合分析的策略与工具．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
三、草类转录组学研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.1转录组测序数据概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.2基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
3.3差异表达基因的鉴定与功能分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
3.4转录因子与调控网络的研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
四、草类小RNA测序研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.1小RNA测序数据概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.2小RNA的鉴定与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
4.3miRNA功能及靶基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
4.4小RNA与性状的关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
五、草类性状联合分析新视角．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
5.1转录组与小RNA测序的联合分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
5.2遗传变异与表型性状的关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
5.3功能性状基因组学研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
5.4草类性状改良的分子机制解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
六、实践应用与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
6.1实践应用案例分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
6.2技术在草类产业中的应用前景展望结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
转录组与小RNA测序：草类性状联合分析新视角（2）．．．．．．．．．．．．．28
内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
1.2目的和意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
转录组与小RNA测序技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
2.1转录组学简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
2.2小RNA测序技术介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
草类性状的生物学特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
3.1草类植物的基本特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
3.2草类植物的生长发育过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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