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银杏R2R3MYB基因家族鉴定及其在花青素合成中的作用.docx

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银杏R2R3MYB基因家族鉴定及其在花青素合成中的作用

银杏R2R3MYB基因家族鉴定及其在花青素合成中的作用（1）．．．．．．．3

一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

二、银杏R2R3MYB基因家族鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

银杏基因组概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1基因组大小与结构特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.2基因组测序与组装情况．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

R2R3MYB基因家族的鉴定方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1生物信息学方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.2分子生物学实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.3基因序列分析软件．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

银杏R2R3MYB基因家族的成员分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

3.1成员数量与分布特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

3.2基因结构与功能特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

三、银杏R2R3MYB基因在花青素合成中的作用研究．．．．．．．．．．．．．．．14

花青素合成途径概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

1.1花青素合成相关基因与酶类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

1.2花青素合成途径的调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

R2R3MYB基因对花青素合成的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

2.1转基因植物中的功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

2.2银杏不同组织部位中基因表达与花青素含量的关系分析．．．．．．19

2.3R2R3MYB基因对花青素合成关键酶基因的调控作用研究．．．．．．．20

四、实验结果与分析讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

银杏R2R3MYB基因家族鉴定及其在花青素合成中的作用（2）．．．．．．22

内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

1.1背景介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

1.2研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

1.3国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

2.1材料来源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.2银杏基因组数据库的构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.3R2R3MYB基因家族的鉴定与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

2.3.1序列比对．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

2.3.2结构域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

2.3.3基因结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.4基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

2.5生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

2.5.1功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．

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