《动力学模拟与分析》课件.pptVIP

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2025-03-10 发布于四川
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《动力学模拟与分析》课件.ppt

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动力学模拟与分析;课程概述;第一章：动力学模拟基础;1.1什么是动力学模拟;1.2动力学模拟的应用领域;1.3动力学模拟的历史发展;1.4动力学模拟的基本原理;1.5牛顿运动定律在动力学模拟中的应用;1.6分子动力学与系统动力学的区别;第二章：分子动力学模拟;2.1分子动力学模拟概述;2.2分子动力学模拟的基本步骤;2.3力场选择;2.4初始构型的确定;2.5边界条件设置;2.6系综选择（NVE、NVT、NPT）;2.7积分算法;2.8温度和压力控制;2.9长程相互作用处理;2.10约束算法;第三章：系统动力学模拟;3.1系统动力学模拟概述;3.2因果回路图;3.3存量流量图;3.4反馈环路;3.5时间延迟;3.6非线性关系;3.7系统动力学建模步骤;3.8模型验证与敏感性分析;第四章：动力学模拟软件;4.1分子动力学软件概述;4.2GROMACS软件介绍;4.3LAMMPS软件介绍;4.4AMBER软件介绍;4.5NAMD软件介绍;4.6系统动力学软件概述;4.7Vensim软件介绍;4.8Stella软件介绍;4.9AnyLogic软件介绍;第五章：动力学模拟结果分析;5.1轨迹分析;5.2均方位移（MSD）分析;5.3径向分布函数（RDF）分析;5.4氢键分析;5.5主成分分析（PCA）;5.6自由能计算;5.7热力学性质计算;5.8结构变化分析;5.9敏感性分析;5.10蒙特卡罗方法在动力学分析中的应用;第六章：动力学模拟的高级技术;6.1增强采样技术;6.2副本交换分子动力学;6.3亚原子尺度建模;6.4多尺度模拟;6.5量子力学/分子力学（QM/MM）混合方法;第七章：动力学模拟在各领域的应用;7.1生物分子模拟;;7.3社会经济系统模拟