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【单细胞测序系列12】只做转录组不做蛋白组，意义少一半？

很多人可能考虑科学研究中，是做WTA，还是做蛋白组，还是都做呢？看过今天小优分享的一篇文献【通过单细

胞基因组学捕获的COVID-19患者免疫细胞的全转录组分析(WTA)和表面标记表达(AbSeq)动态】或许你会有新的看法。

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一、实验简介

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二、实验思路框架

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健康、SARSCoV-2感染和恢复的样本分为三组，工作流程原理图如上，然后进行WTA和AbSeq的文库制备和scRNA

测序。

1、样本制备

外周血采集运输：单个细胞制备准备管CPTcellpreparationtubes(Becton,DickinsonandCompany,

UnitedStates,Catalogno362753)

PBMC制备获得：（点击可查看具体PBMC操作细节）

样本混样：多个样本混合处理2×10^5cellspersample，采用BDRhapsody的混样试剂盒（BDsinglecell

multiplexingkit-human,Catalogno：633781）

不同样本通过SampleTag标记后，可混合检测

2、CellSurfaceMarker染色

带有oligo寡核苷酸的抗体能够在单细胞测序实验中同时检测蛋白质和mRNA表达，有助于加深对蛋白质生物学

的理解，并加速单细胞研究。

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40个指标选择意义

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3、RNA捕获、文库、测序

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三、实验结果说明

1、mRNAcellmap细胞图谱结果

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从三类样本健康、COVID-19感染者和康复者收集到的124,726细胞，通过T-SNE做可视化分析，分成了17个

不同免疫群。

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通过柱状图，将17个免疫亚群在三类不同来源样本（健康、COVID-19感染者和康复者）做了比例说明。

2、mRNA转