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花生MTM1基因的生物信息学分析研究

目录

花生MTM1基因的生物信息学分析研究（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

二、研究背景与目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

三、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

3.1花生MTM1基因序列获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

3.2生物信息学软件与数据库．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

3.3分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

四、花生MTM1基因基本信息分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

4.1基因序列特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

4.2编码蛋白质的基本性质预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

4.3进化分析与物种比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

五、花生MTM1基因功能研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

5.1基因表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

5.2蛋白质结构预测与功能域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

5.3通路分析与信号转导研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

六、花生MTM1基因与其他植物的比较研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

6.1与其他植物MTM基因家族的对比．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

6.2花生MTM基因家族的差异表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

七、实验验证与分析结果讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

7.1实验验证方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

7.2结果讨论与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

八、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

8.1研究成果总结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

8.2后续研究方向与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

花生MTM1基因的生物信息学分析研究（2）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

一、内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

1.2研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

1.3研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

2.1样品来源与采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

2.2实验材料准备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

2.3实验设计与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.4数据收集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

三、花生MTM1基因序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

3.1序列比对与命名．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

3.2基因结构与功能域预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

3.3基因组定位与结构特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

四、花生MTM