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生物进化分析;课程概述;第一部分:进化理论基础;达尔文进化论;现代综合进化论;分子进化中性理论;进化的证据;进化的证据(续);第二部分:分子进化分析方法;序列比对;序列比对工具;进化距离计算;系统发育树构建方法;贝叶斯推断法;系统发育树评估;分子钟假说;分子钟校准;第三部分:基因组学时代的进化分析;全基因组比较;水平基因转移;基因家族进化;正选择检测;群体基因组学;系统发育基因组学;宏基因组学与进化;第四部分:进化分析工具和数据库;序列分析软件;基因组分析工具;进化数据库;系统发育数据库;第五部分:进化分析在生物学研究中的应用;物种鉴定与分类;进化发育生物学;适应性进化研究;物种起源与灭绝;人类进化研究;古DNA分析;癌症进化;病原体进化;保护生物学;第六部分:进化分析的前沿领域;表观遗传进化;调控元件进化;蛋白质结构与功能进化;非编码RNA进化;基因表达进化;共生进化;趋同进化与趋异进化;进化中的系统生物学;进化计算与人工生命;第七部分:进化分析的挑战与展望;大数据时代的挑战;方法学的发展;进化理论的更新;跨学科融合;实验进化学;进化生物学的社会影响;未来研究方向;总结;参考文献与推荐阅读
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