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利用比较转录组学揭示青海湖裸鲤适应盐碱环境的基因机制
目录
利用比较转录组学揭示青海湖裸鲤适应盐碱环境的基因机制（1）．．3
内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.2研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.3研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
青海湖裸鲤的生态适应性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
2.1青海湖的盐碱环境特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.2裸鲤的适应性特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
转录组学技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
3.1转录组学的原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
3.2转录组学在基因研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
青海湖裸鲤转录组数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
4.1数据采集与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
4.2基因表达量差异分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
4.3基因功能注释与聚类分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
盐碱环境适应性相关基因的筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
5.1盐碱环境响应基因的识别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
5.2基因功能验证与机制研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
盐碱环境适应性相关信号通路分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
6.1信号通路识别与构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
6.2信号通路活性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
青海湖裸鲤盐碱环境适应性的基因调控网络构建．．．．．．．．．．．．．26
7.1调控网络构建方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
7.2调控网络功能分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
利用比较转录组学揭示青海湖裸鲤适应盐碱环境的基因机制（2）．30
一、内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
1.1青海湖裸鲤概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
1.2盐碱环境特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
1.3比较转录组学方法简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
二、研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
2.1研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
2.2研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
三、实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
3.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
3.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
3.2.1转录组测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
3.2.2数据处理与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
3.2.3差异表达基因筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
四、结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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