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基于转录组测序技术的燕山红玉肉鸡屠宰性状功能基因挖掘

目录

基于转录组测序技术的燕山红玉肉鸡屠宰性状功能基因挖掘（1）．．3

内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.3国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1燕山红玉肉鸡样品采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.2转录组测序技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.3数据预处理与质量控制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.4基因表达定量分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.5功能基因筛选与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

3.1转录组测序数据基本分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.2屠宰性状相关基因的筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

3.3功能基因的生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

3.4功能基因的实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

功能基因的功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

4.1基因功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

4.2功能基因表达调控实验．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

4.3功能基因对屠宰性状的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

讨论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

5.1研究结果讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

5.2存在的问题与挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

5.3未来研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

基于转录组测序技术的燕山红玉肉鸡屠宰性状功能基因挖掘（2）．28

一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

（一）研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

（二）研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

（三）研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

（一）实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

（二）样本采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

（三）转录组测序与数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

（四）功能基因筛选与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

三、燕山红玉肉鸡屠宰性状相关基因的转录组学分析．．．．．．．．．．．．36

（一）基因表达谱构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

（二）差异表达基因筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

（三）基因序列比对与结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

（四）基因表达量相关性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

四、关