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GC-MS数据处理系统

一、GC-MS数据的处理

GC-MS以其优异的分离定性特点，被广泛地应用于分析复杂混合物中的挥发性

组分。然而，其质谱图会包含一些来自于离子源污染物、柱流失物、基质干扰物所

产生的离子，导致定性准确性降低。在分析复杂基质中的痕量物质时，这一现象尤

为突出。例如，在食品中农药多残留的分析中，为了确保各种极性的农药都有很好

的回收，样本中的基质都会不可避免地被引入检测过程中，对目标化合物的质谱图

产生严重的干扰。同时某些保留时间相近的化合物的质谱图也会叠加在一起，相互

干扰。这些问题的存在使农药确认变得更为困难。因此，通过对质谱数据的后处理，

将目标化合物的质谱图从原始谱图中提取出来，根据新建的“纯净”的质谱图对目

标化合物进行确证将更有实际应用的价值。

通常提取“纯净”的质谱图的方法是扣除“本底”的方法，主要过程为从目标

化合物的质谱图中减去其周围本底的质谱图。然而其效果只能去除那些相对丰度较

低的本底干扰离子（例如柱流失物所产生的碎片离子）。对于丰度较高的共流出物及

复杂基质干扰物的离子，扣“本底”的方法无能为力。为了能够达到更好的“净化”

效果，化学计量学的方法被应用于质谱数据后处理中，通过数学计算对质谱数据进

行退卷积处理，以提取“纯净”的质谱图。

这里，基于美国国家标准技术研究院(NIST)开发的一套软件AMDIS(Automated

MassSpectralDeconvolutionIdentificationSystem)，对质谱数据的处理分为三个部

分：

1、噪声分析（NoiseAnalysis）：对数据文件的噪声进行分析，从中提取意

义的特征离子，从而排除噪音对后续工作的干扰。即从数据文件中提取

信号特征，供随后的噪声处理及阈值设定之用。

2、化学成分扫描（ComponentPerception）：对整个数据文件进行分析，扫

描每个化合物色谱峰以检测其模型离子（ModelPeak）及其峰形。

3、谱图退卷积（SpectrumDeconvolution）：模型离子确立后，将其峰形与

其它离子进行比较，将在此时间范围内与模型离子（ModelPeak）峰型

相近的离子提取出来，建立一张新的“纯”的质谱图。

二、GC-MS数据的存储格式

2.1JCAMP格式

NIST05库中记录导出格式:JCAMP格式。JCAMP是原子分子物理数据联合委

员会（JointCommitteeonAtomicandMolecularPhysicalData）的缩写，该委员会由

美国化学协会、美国物理协会、美国质谱协会等多家协会共同组建，其目标是制定

原子分子物理数据通用的存储格式，使得不同的数据系统可以方便地交换数据。该

组织发布的文件格式称为JCAMP-DX标准。从1988年用于红外光谱的JCAMP-DX

4.24版本的发布和成功应用开始，到目前为止，已经陆续发布了用于化学结构表示、

核磁共振（NMR）、质谱、离子迁移谱等多个领域的JCAMP-DX标准。根据JCAMP

标准生成的文件称为JCAMP文件，后缀名一般为jdx或dx。JCAMP标准最鲜明的

特点就是在文件中全部使用ASCⅡ码字符中的可打印字符，使得文件可以方便地在

不同的计算机平台间交换，并使文件具有相当程度的可读性。

标记数据记录（Labeled-Data-Record,LDR）是组成JCAMP的基本单元，它包

括名字和数据两部分，其中名字以前缀##开始，后面紧接着=，在后面是对应的数

据。名称不区分大小写，同时空格和下划线等字符也被忽略不计。在JCAMP-DX5.0

标准中，预定义了许多LDR，根据其重要性和用途，这些LDR被分为核心（CORE）

和注释（NOTE）两部分。核心部分包括数据以及软件正确处理这些数据所需要的

参数。注解部分，则被用来补充关于这些数据的背景知识，如杨平处理、实验条

等等，主要提供给用户阅读。另一方面，根据LDR的使用范围，又将它们分为全局

LDR（GLOBAL，适用于所有JCAMP-DX应用）和特定数据类型专用LDR（例如，

MS数据类型专用）两种。

2.2SPC格式

美国热电公司（ThermoElectronCorporation）于上世纪90年