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ICS67.060
DB13
B22
河北省地方标准
DB13/T2598—2017
花生品种真实性与纯度鉴定SSR法
河北省质量技术监督局
发布
DB13/T2598—2017
前
言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
本标准由河北农业大学提出。
本标准起草单位:河北农业大学。
本标准主要起草人:杨鑫雷、刘立峰、崔顺立、郭丽果、陈焕英、穆国俊、李洪珍。
I
DB13/T2598—2017
花生品种真实性与纯度鉴定SSR法
1
范围
本标准规定了利用SSR标记对花生品种真实性与纯度进行鉴定的术语和定义、原理、试剂材料、操
作程序、数据分析和判定规则。
本标准适用于利用SSR法对花生品种真实性与纯度鉴定的试验过程。
2
规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T3543.2-1995
GB/T3543.4-1995
GB/T6682-2008
农作物种子检验规程
农作物种子检验规程
扦样
发芽试验
分析实验室用水规格和试验方法
3
术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
品种在特征特性方面典型一致的程度,用供检样品中本品种的种子数占样品种子总数的百分率表
简单重复序列SSR(SimpleSequenceRepeat)
基因组中以几个核苷酸(一般为2个~6个)为重复单元的长达几十至几百个核苷酸的串联重复序
列,又称微卫星标记。
注:模板DNA经高温变性为单链,在DNA聚合酶和适宜温度下,两条引物分别与DNA模板两条链上的一段互补
序列发生退火,并在DNA聚合酶的催化下以四种dNTP(deoxy-ribonucleosidetriphosphate,脱氧核苷三磷酸)为底
物,使退火引物延伸从而合成DNA。如此变性退火和合成DNA反复循环,使位于两段已知序列之间的DNA片段呈几
何倍数扩增。
1
DB13/T2598—2017
3.5
引物Primer
结合在模板DNA上的互补短链,提供3'-OH末端作为DNA合成的起点,延伸合成模板DNA的互补
链。
3.6
核心引物CorePrimer
SSR标记分析优先选用多态性高、稳定性好,识别能力强的一套引物的引物。
3.7
标准样品StandardSample
代表已知品种特征特性的育种家种子作为标准样品。
4
原理
花生基因组中存在着大量简单重复序列(SSR),由于SSR单元在不同基因型间重复次数不同,因
此同一位点的SSR在不同品种间往往具有丰富的长度多态性。利用PCR技术扩增每个位点的简单重复序
列,通过电泳分析其长度多态性,达到区别不同花生品种的目的。
5
试剂或材料
乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA·Na2):分子式为C10H16N2O8Na2·2H2O,CAS60-00-4。
十二烷基硫酸钠(SDS):分子式为C12H25NaO4S,CAS151-21-3。
聚乙烯吡咯烷酮(PVP):分子式为(C6H9NO)41,CAS9003-39-8。
β-巯基乙醇:分子式为C2H6OS,CAS60-24-2。
2
DB13/T2598—2017
5.14
5.15
5.16
5.17
5.18
乙酸铵:分子式为C2H7NO2,CAS631-61-8。
十二烷基肌氨酸钠:分子式为C15H28NO3·Na,CAS137-16-6。
异丙醇:分子式为C3H8O,CAS67-63-0。
氯化钠:分子式为NaCl,CAS7647-14-5。
氢氧化钠:分子式为NaOH,CAS1310-73-2。
5.19TaqDNA聚合酶:保存条件为-20℃±2℃。
5.20
5.21
5.22
5.23
5.24
5.25
5.26
四种脱氧核苷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP),缩略为dNTPs。
硼酸:分子式为BH3O3,CAS11113-50-1。
丙三醇:分子式为C3H8O3,CAS56-81-5。
溴酚蓝:分子式为C19H10Br4O5S,CAS115-39-9。
二甲苯氰FF:分子式为C25H27N2NaO7S2,CAS4463-44-9。
丙烯酰胺:分子式为C3H5NO,CAS79-06-1。
甲叉双丙烯酰胺:分子式为C7H10N2O2,CAS110-26-9。
5.27N,N,N′,N′-四甲基乙二胺(TEMED):分子式为C10H24N2,CAS150-77-6。
121.1gTris碱溶于适量水中,加HCl调pH至7.5,定容至1L,1.05kg/cm高压蒸汽灭菌15min,
2
4℃贮存。
称取84.78gLiCl置于
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