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ICS11.220
B41
DB22
吉林省地方标准
DB22/T2010—2014
家畜(猪牛羊)戊型肝炎病毒的测定
RT-PCR法
DetectionofHepatitisEvirusbyRT-PCRinLivestock(pig/cattle/sheep)
吉林省质量技术监督局
发布
DB22/T2010—2014
前
言
本标准按照GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2001给出的规则起草。
本标准由吉林省畜牧业管理局提出并归口。
本标准起草单位:吉林省畜牧兽医科学研究院。
本标准主要起草人:苏双、邵洪泽、许志林、程荣华、王楠、李琳、毛文智、王忠国、李文东,于
丹。
1
DB22/T2010—2014
家畜(猪牛羊)戊型肝炎病毒的测定RT-PCR法
警告─使用本标准的人员应有正规实验室工作的实践经验。本标准并未指出所有可能的安全问题。
使用者有责任采取适当的安全和健康措施,并保证符合国家有关法规规定的条件。
1范围
本标准规定了家畜(猪牛羊)戊型肝炎病毒RT-PCR测定方法。
本标准适用于猪、牛、羊等家畜戊型肝炎病毒的测定。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
3术语和定义
戊型肝炎病毒科成员。一种单股正链RNA病毒,呈球形、直径27~34nm,无囊膜,核衣壳呈二十
面体立体对称。病毒基因组长约7.2knt,有3个开放阅读框(ORF1、ORF2、ORF3)。ORF2位于3′端,
为主要的结构基因编码区,可编码核衣壳蛋白。
聚合酶链反应(PCR)技术是一种在体外快速扩增特定DNA片段的方法。由热变性→复性→延伸
三步反应组成一个PCR循环,经过多次循环反应,使目的DNA得以大量扩增。
4试剂与材料
2
DB22/T2010—2014
引物序列见表1,引物浓度为25mmol/L。
表1特异性引物序列
引物种类
外引物
引物名称
HEV-1
HEV-2
HEV-3
HEV-4
特异性引物的核苷酸序列
扩增片段长度(bp)
5-TAYCGHAAYCAAGGHTGGCG-3
5-TGYTGGTTRTCRTARTCCTG-3
5-ATWCATGGVTCRCCTGTGAA-3
5-AAATYAATTCTGTCGGRAGC-3
524
(第1次PCR引物)
内引物
328
(第2次PCR引物)
注:R=A/G,Y=C/T,W=A/T,H=A/C/T,V=A/C/G。
4.2
试剂
4.2.1
RNA提取试剂盒
4.2.2RT-PCR试剂盒
4.2.3DNA分子质量标准(DNAMarker)
DNA分子质量标准可采用100bpDNAladderMaker、DNAMarkerDL2000或其它等效产品。
4.2.4其它试剂
4.2.4.1
4.2.4.2
4.2.4.3
4.2.4.4
双蒸水:符合GB/T6682中4.2二级水要求;
0.1%DEPC水:见附录A中A.1;
4.3.1一次性无菌手套或乳胶手套;
4.3.21.5mL离心管;
4.3.30.2mLPCR反应管;
4.3.4琼脂糖;
5仪器设备
3
DB22/T2010—2014
5.3电泳槽;
5.4紫外光透射仪或凝胶成像系统;
5.5高速台式冷冻离心机:12000r/min;
5.6微型高速离心机:12000r/min;
5.7水浴锅:30-100℃;
5.8分析天平:感量0.1g;
5.9微波炉;
5.10-20℃冰箱;
5.11旋涡振荡器;
5.12乳钵或玻璃研磨器;
5.13微量移液器。
6样品的采集及处理
6.1肝脏样品的采集及处理
采取肝脏样品约1.0~2.0g,置于灭菌研钵中,充分研磨成匀浆,加入灭菌的1mol/LPBS溶液配
成1︰5乳悬液,反复冻融3次。4℃8000r/min离心5min,收集上清液,供RNA抽提或者-20℃保存备
用。
6.2粪便样品的采集及处理
挑取0.5~1.0g粪便样品于1.5mL离心管内,加入灭菌的1mol/LPBS溶液,旋涡震荡混匀,制备
成10%的粪便悬液,4℃8000r/min离心10min,收集上清液,供RNA抽提或者-20℃保存备用。
取上述处理好的样品100μL于1.5mL无RNA酶离心管中,每管加入1000μLTrizol试剂,混匀,
室温放置5m
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