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单细胞多组学揭示川崎病免疫发病机制的研究进展

[关键词]川崎病；单细胞多组学；免疫；发病机制

[中图分类号]R725[文献标识码]A[DOI]10.3969/j.issn.1673-9701.2025.05.028

1单细胞多组学概述

单细胞测序技术经历由初步探索到成熟应用的发展历程。单细胞测序可快速筛查与定量分析特定样本，对免疫细胞表型和可塑性及细胞间相互作用网络进行不同通量和覆盖程度的深入研究，进而从单细胞水平揭示免疫系统状态[6]。单细胞多组学是一项可在同一细胞中同时测量多种组学数据的前沿技术。单细胞多组学技术包括用于DNA序列分析的单细胞DNA测序、用于基因表达分析的单细胞RNA测序（single-cellRNAsequencing，scRNA-seq）、用于对生物体内所有代谢物进行定量分析并寻找其与病理生理学变化相关性的代谢组学、用于染色质结构组织的单细胞高通量染色体构象测序、用于组蛋白修饰分析的单细胞核酸酶靶向切割和释放、用于受体谱系多样性和克隆谱分析的单细胞T细胞或B细胞受体测序等[7]。单细胞多组学通过同时整合转录组、基因组、蛋白质组、代谢组及其他组学等各种单模态组学，更真实地展现细胞的状态和活性[8]。

作为最成熟的单细胞测序方法，通过将单细胞转录组学与其他组学相结合研究基因表达与表型异质性的相关性。在全基因组scRNA-seq的基础上，多组学可通过细胞多路复用、细胞标记和其他方法进行多模态复用并增加通量[8]。随着单细胞技术的进步，研究多细胞生物如何从一个全能的单细胞发育而来，需要依赖单细胞与空间多组学方法，以实现在组织内部对基因表达等信息的空间定位[9]。这些综合技术包括基因组与转录组的结合、转录组与表观基因组的融合、转录组与蛋白质组的联合及其他多组学模型的集成。单细胞多组学给免疫学带来更全面的本质性变革，包括但不限于监测免疫细胞在特定疾病环境下的相互作用、推测抗原与免疫受体间动力学关系的复杂性、确定用于预测治疗反应的生物标志物等。

2单细胞多组学在自身免疫性疾病中的应用

自身免疫性疾病是一类由于免疫系统失去对自身抗原的耐受性而引发组织损伤和炎症反应并最终导致靶器官损伤的慢性疾病[10]。病原微生物通过分子模拟、旁观者激活和表位扩展等不同机制参与自身免疫性疾病的发生和进展过程[11]。自身免疫性疾病发病复杂，应用传统技术难以阐明其机制，单细胞测序可更深层解释免疫细胞在特定疾病下的相互作用，为其治疗指明方向。

Ashton等[12]应用scRNA-seq技术发现树突状细胞在类风湿关节炎、系统性红斑狼疮及1型糖尿病等疾病中转录水平的变化，指出树突状细胞与疾病的活动程度相关，表明免疫细胞转录谱可提高检测疾病异质性的能力，并指导复杂自身免疫性疾病治疗方法的选择。Culemann等[13]应用scRNA-seq和光片三维荧光成像技术对健康和炎症关节中不同亚型巨噬细胞的组成、来源及分化路径进行对比，发现源自组织内的CX3CR1+巨噬细胞亚群可在滑膜内层构建免疫屏障，有效保护关节并控制炎症。Ahmed等[14]为研究细胞分辨率下双重表达者的双重表型，利用scRNA-seq技术检测其转录组，结果显示双重表达者在1型糖尿病患者体内克隆扩增，T细胞和B细胞的区隔化不是绝对的，这可能是导致自身免疫性疾病的关键驱动因素。综上，单细胞多组学可推进相关疾病免疫发病机制的深入研究及免疫制剂的精准应用。

3单细胞多组学揭示KD免疫发病机制的研究进展

3.1动物实验

现阶段，国内外学者大多选用小鼠作为KD动物实验模型。从组织学角度看，干酪乳杆菌细胞壁提取物（Lactobacilluscaseicellwallextract，LCWE）引发的小鼠心血管损伤与KD患儿相关CAL相似。Marek-Iannucci等[16]研究发现，将LCWE注射到小鼠体内，建立全身动脉炎模型；通过分析LCWE小鼠模型腹主动脉scRNA-seq结果发现，动物模型存在内质网应激基因表达的改变；通过有条件地敲除骨髓细胞中的肌醇需求酶1（inositol-requiringenzyme1，IRE1）或抑制IRE1核糖核酸酶活性，从基因水平上减轻内质网应激，显著减少LCWE诱导心血管病变的形成，降低胱天蛋白酶-1活性，减少白细胞介素（interleukin，IL）-1β的分泌。该研究证实KD血管炎小鼠模型中心血管病变的发病机制与内质网应激增加相关，强调IRE1和核糖核酸酶活性作为潜在治疗靶点的重要性。Porritt等[17]成功整合scRNA-seq、空间转录组学和流式细胞术，确定在KD发展过程中，核苷酸结合结构域富含亮氨酸重复序列和含热蛋白结构域受体3-IL-1β/IL-18轴是决定性的驱动因子，这些新结构可能与内皮细胞增殖有关，血管平滑肌细胞中IL-1受体的特异性缺