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干旱气候环境下细菌群落的协同共生模式与适应性研究

目录

内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1.1干旱环境特征概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.1.2微生物在干旱生态系统中的地位．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.1.3探究菌群互作与适应性的科学价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.2.1干旱地区微生物生态学研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

1.2.2菌群共生态学机制相关探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.2.3微生物环境适应策略研究概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

1.3.1核心研究问题界定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

1.3.2主要研究内容安排．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

1.4技术路线与研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

1.4.1研究区域与样品采集方案．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

1.4.2实验室处理与分析技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

1.4.3数据分析方法说明．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

研究区域概况与样品采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

2.1研究区域自然环境特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.1.1地理位置与气候条件．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.1.2土壤理化性质分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

2.1.3植被覆盖与生境类型．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.2样品采集过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.2.1采样点布设依据．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.2.2不同生境样品获取方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

2.2.3样品现场处理与保存．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

干旱环境下细菌群落的组成与结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

3.1宏观群落结构特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

3.1.1细菌总量与优势类群鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

3.1.2物种多样性与均匀度评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

3.2微观群落结构解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

3.2.1高通量测序技术应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

3.2.2Alpha多样性指数计算与比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

3.2.3Beta多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

3.3功能基因群落特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

3.3.1关键代谢功能基因丰度分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

3.3.2功能预测与群落生态功能推测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

干旱环境下细菌群落的协同共生模式探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55

4.1菌群共现网络构建与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

4.1.1共现关系网络图谱绘制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．