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三七休眠调控DOG基因家族的全基因组鉴定与表达谱分析
目录
三七休眠调控DOG基因家族的全基因组鉴定与表达谱分析（1）．．．．．6
内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.1.1三七的经济价值与药用研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.1.2植物休眠现象的生物学意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
1.1.3DOG基因家族在植物发育与胁迫响应中的功能．．．．．．．．．．．．．．9
1.2国内外研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
1.2.1植物休眠调控机制研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
1.2.2DOG基因家族功能研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
1.2.3基于基因组学技术研究植物基因家族．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
1.3.1研究目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
1.3.2研究内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
2.1试验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
2.1.1三七种质资源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
2.1.2试验试剂与仪器．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
2.2试验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
2.2.1基因组DNA提取与测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
2.2.2DOG基因家族成员鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
2.2.3DOG基因家族成员结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
2.2.4DOG基因家族系统发育分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
2.2.5DOG基因家族染色体定位．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
2.2.6DOG基因家族启动子区域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
2.2.7DOG基因家族表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
2.3软件平台．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
3.1三七基因组数据质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
3.2DOG基因家族成员鉴定与结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
3.2.1DOG基因家族成员数量与分布．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
3.2.2DOG基因家族成员结构特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
3.3DOG基因家族系统发育分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46
3.4DOG基因家族染色体定位．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47
3.5DOG基因家族启动子区域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48
3.5.1保守基序分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51
3.5.2转录因子结合位点分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
3.6DOG基因家族表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
3.6.1不同组织中的表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
3.6.2不
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