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单细胞转录组测序技术在花斑裸鲤造血器官细胞图谱构建中的应用
目录
单细胞转录组测序技术在花斑裸鲤造血器官细胞图谱构建中的应用（1）
内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.2花斑裸鲤种质资源保护现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.3造血器官发育与功能概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
1.4单细胞转录组测序技术原理与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
2.1.1花斑裸鲤样本来源与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.1.2主要试剂与仪器．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
2.2单细胞分离．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
2.2.1造血器官组织采集与消化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
2.2.2单细胞悬液制备与纯化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
2.3单细胞转录组测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
2.3.1总RNA提取与质量控制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
2.3.2单细胞库构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
2.3.3测序平台与数据分析流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
2.4数据质控与分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
2.4.1数据预处理与质量控制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
2.4.2变量基因筛选与差异表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
2.4.3细胞聚类与亚群鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
2.4.4造血器官细胞图谱构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
3.1单细胞转录组测序数据质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
3.2花斑裸鲤造血器官细胞群体分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
3.2.1细胞数量与分布特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47
3.2.2主要细胞亚群鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48
3.3造血器官细胞亚群特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49
3.3.1不同细胞亚群基因表达谱差异．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51
3.3.2关键调控基因鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
3.4花斑裸鲤造血器官细胞图谱构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
3.4.1细胞图谱可视化展示．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58
3.4.2细胞图谱生物学意义解读．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59
单细胞转录组测序技术在花斑裸鲤造血器官细胞图谱构建中的应用（2）
内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61
1.2文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62
1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64
实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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