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转录组测序技术在石斛生物碱和人参皂苷合成基因研究中的应用
目录
转录组测序技术在石斛生物碱和人参皂苷合成基因研究中的应用（1）
内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2石斛与人参的药用价值概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.3欧米茄内酯类物质及人参皂苷的生物合成途径简介．．．．．．．．．．8
1.4高通量转录分析技术的崛起与发展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
转录组测序技术原理及方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
2.1转录组测序的基本概念．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
2.2样本采集与总RNA提取策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
2.3mRNA分离与测序适配体连接．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
2.4高通量测序平台的选择与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
2.5数据原始序列的质控与过滤．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
转录组测序在欧米茄内酯类物质合成基因研究中的应用．．．．．．16
3.1石斛中欧米茄内酯类物质的研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
3.2基于转录组数据的差异基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
3.3欧米茄内酯类物质合成相关候选基因的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．21
3.4功能验证实验设计思路．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
3.5转录调控因子与信号通路分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
转录组测序在人参皂苷合成基因研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．25
4.1人参皂苷的生物合成途径与调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
4.2利用转录组数据挖掘人参皂苷合成关键酶基因．．．．．．．．．．．．．28
4.3不同生长阶段或处理下基因表达模式的比较．．．．．．．．．．．．．．．29
4.4基于转录组数据的通路富集与功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
4.5转录组学与其他组学数据结合的潜力．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
数据整合分析与结果解读．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
5.1跨物种比较转录组分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
5.2多组学数据整合策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
5.3生物信息学工具与数据库资源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
5.4研究结果的生物学意义与潜在应用价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
讨论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
6.1转录组测序技术在本领域应用的局限性与挑战．．．．．．．．．．．．．41
6.2未来研究方向与改进策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
6.3对石斛与人参资源利用和次生代谢调控的启示．．．．．．．．．．．．．44
转录组测序技术在石斛生物碱和人参皂苷合成基因研究中的应用（2）
一、内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46
1.2研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48
二、转录组测序技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49
2.1转录组测序的定义与原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50
2.2转录组测序技术的发展与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
三、石斛生物碱合成基因研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
3.1石斛生物碱概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55
3.2转录组测序在石斛生物碱合成基因研究中的应用．．．．．．．
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