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第一章
基因组概论
细胞内的遗传物质3.基因(gene)基因组的功能单位。1.染色体(chromosome)和染色质(chromatin):细胞内的一种形态结构,易被碱性染料染成深色,由核酸和蛋白质组成。2.基因组(genome):细胞中一套完整单体遗传物质的总和。
产物:蛋白质或RNA合成有功能的蛋白质或RNA所必需的全部DNA序列(除部分病毒RNA),即一个基因不仅包括编码蛋白质或RNA的核酸序列(编码序列),还应包括为保证转录所必需的调控序列(非编码序列)。基因(gene)的分子生物学定义本质:DNA或RNA
转录单位(transcriptionunit)
蛋白基因鉴别标准开放阅读框架(openreadingframe,ORF)始于起始密码子并终于终止密码子的一串密码子组成的核苷酸序列密码子偏爱序列保守性转录产物基因失活
总结:1、DNA与染色体的关系:2、DNA分子的特点:3、DNA与基因的关系:4、DNA是DNA是组成染色体的主要物质相对分子质量很大,分子由两条长链组成,盘成螺旋状(双螺旋)基因是DNA分子上起遗传作用的一些片段(相当于火车与车厢的关系)一种遗传物质,但不是唯一的一种。染色体DNA基因
基因组(genome)(P10)是指生物体全套单倍体遗传信息,包括所有基因和基因间的区域。01对人类而言:22+X+Y+mtDNA0246,XY03&细胞中一套完整单体遗传物质的总和。04
基因总数基因大小基因组中基因数目与生物进化程度和复杂程度的不对称性——N值矛盾(Nvalueparadox)基因组中基因大小(bp)与生物进化程度和复杂程度的不对称性——C值矛盾(Cvalueparadox)
基因组计划以获得某物种基因组全序列为主要目标的科学计划——基因组计划基本原理:人类基因组DNA?打碎?拼接
基因组测序计划?海量DNA序列数据DNA序列是生命的真谛,这个世界上发生的一切事情都与这一序列息息相关。人类基因组计划(HGP)1990年启动目标:测定人类基因组的全部DNA序列,了解基因及其功能国际大合作:美国、英国、日国、法国、德国、中国投入:30亿美元结果:2003年完成精细图,产生约32亿个数据(碱基)
12543人类基因组计划(humangenomeproject,HGP)遗传图谱(geneticmap)(连锁图linkagemap)用遗传标签确定基因排列顺序物理图谱(physicalmap):确定排列距离序列图谱(sequencemap):碱基排列顺序12345
2025/6/4复旦大学图书馆文献检索教研室核酸序列检索检索字段限制01基因位置限定03分子类型选择02序列片段限定04数据更新,日期限定05功能栏06
2025/6/4复旦大学图书馆文献检索教研室序列存取号01.基因定义01.数据库标识符01.
2025/6/4复旦大学图书馆文献检索教研室P3P2P1代码物种来源参考文献P4特性
2025/6/4复旦大学图书馆文献检索教研室原序列复制后,可到BLAST中进行相似性对本
ACGT#2022
基因组学(genomics)对所有基因进行基因组作图,核苷酸序列分析,基因定位和基因功能分析的一门科学。结构基因组学(structuralgenomics)以全基因组测序为目标功能基因组学(functionalgenomics)以基因功能鉴定为目标
功能基因组学——后基因组计划功能基因组学01蛋白质组学02比较基因组学03环境基因组学04药物基因组学05基因组多态性的研究06模式生物体基因组研究07
掌握下列概念基因结构基因基因组基因组学开放阅读框架HGP
第二章原核生物基因组特征原核生物(prokaryote)是细菌、支原体、衣原体、立克次体、螺旋体、放线菌和蓝绿藻等原始生物的总称,是最简单的细胞生物体。
原核生物基因组特点添加标题基因组较小,通常由一条环状双链DNA(doublestrandedDNA,dsDNA)分子组成。添加标题大肠杆菌基因组DNA分子量为2.64×109Da,由4.2×106bp组成,是人类基因组的1‰,且基因数目也较少,大约含3500个基因。添加标题类核结构
②操纵子结构是原核生物基因组的功能单位多顺反子mRNA(polycistronicmRNA)在共同的启动子作用下,转录出的一个mRNA分子带有几种蛋白质的遗传信息,可编码几种不同的,但多为功能相关的蛋白质。
结构基因通常以单拷贝形式存在
rRNA及tRNA基因多拷贝非编码
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