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白斑综合征病毒(WSSV)环介导等温扩增(LAMP)检测技术规范
范围
本标准规定了白斑综合征病毒(WSSV)环介导等温扩增(LAMP)检测的基本要求、试剂、仪器设备、操作步骤、结果判定和质量控制等内容。
本标准适用于对虾及相关养殖环境中白斑综合征病毒的快速检测。
规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
NY/T896水产用化学药品、抗生素残留物的测定高效液相色谱法
术语和定义
白斑综合征病毒(WSSV)
是一种感染对虾的杆状、有囊膜的双链DNA病毒,可引起对虾的白斑综合征,具有高致病性和高死亡率。
环介导等温扩增(LAMP)
是一种新型的核酸扩增方法,通过设计针对靶基因的4条或6条特异性引物,在具有链置换活性的DNA聚合酶作用下,在等温条件(通常60-65℃)下实现核酸的高效、快速扩增。
基本要求
实验室环境
检测实验室应分为样品处理区、试剂准备区、扩增及产物检测区,各区域应保持相对独立,避免交叉污染。实验室应保持清洁、通风良好,温度和湿度应符合实验要求。
人员要求
操作人员应经过专业培训,熟悉LAMP检测技术的原理、操作流程和质量控制要求。在操作过程中,应严格遵守实验室安全规程和生物安全要求,穿戴好工作服、手套、口罩等防护用品。
试剂
引物
-引物设计:根据WSSV的保守基因序列设计4条LAMP特异性引物,包括两条内引物(FIP和BIP)和两条外引物(F3和B3)。引物应具有良好的特异性和扩增效率。
-引物合成:引物由专业的生物技术公司合成,合成的引物应进行质量检测,确保其纯度和浓度符合要求。
-引物保存:引物用TE缓冲液(pH8.0)溶解,配制成一定浓度的储存液,-20℃保存。使用前,可将储存液稀释成工作液,4℃短期保存。
反应试剂
-无菌去离子水:符合GB/T6682一级水的要求,用于配制反应体系。
-2×反应缓冲液:包含Tris-HCl、KCl、MgSO?、(NH?)?SO?等成分,提供适宜的反应环境。
-镁离子溶液:一般使用25mmol/L的硫酸镁溶液,用于调节反应体系中的镁离子浓度。
-dNTPs混合液:包含dATP、dTTP、dCTP和dGTP,每种dNTP的浓度为10mmol/L。
-BstDNA聚合酶:具有链置换活性,用于催化DNA的合成。酶的活性单位应符合要求,应在-20℃保存。
-阳性对照模板:用已知的WSSV阳性样品提取的DNA作为阳性对照模板,其浓度应经过标定。
-阴性对照模板:用健康对虾组织提取的DNA或无菌去离子水作为阴性对照模板。
核酸提取试剂
-裂解液:含有蛋白酶K、SDS等成分,用于裂解细胞,释放核酸。
-酚-氯仿-异戊醇(25∶24∶1):用于去除蛋白质等杂质,纯化核酸。
-无水乙醇:用于沉淀核酸。
-70%乙醇:用于洗涤沉淀的核酸。
-TE缓冲液(pH8.0):用于溶解沉淀的核酸。
仪器设备
核酸提取设备
-离心机:具有冷冻功能,最大转速不低于12000r/min,用于分离和沉淀核酸。
-恒温金属浴或水浴锅:温度精度为±0.5℃,用于核酸提取过程中的孵育步骤。
LAMP扩增设备
-恒温扩增仪:能够精确控制反应温度在60-65℃,温度波动范围不超过±0.5℃。
-旋涡振荡器:用于混合反应试剂。
产物检测设备
-凝胶成像系统:用于观察和分析LAMP扩增产物的凝胶电泳结果。
-比色管或离心管:用于观察反应产物的颜色变化。
操作步骤
样品采集与处理
-样品采集:采集疑似感染WSSV的对虾组织,如鳃、肝胰腺、肌肉等,每个样品至少采集3只虾。同时,采集养殖环境样品,如水样、底泥等。
-组织处理:将采集的对虾组织用无菌剪刀剪碎,加入适量的裂解液,用组织匀浆器匀浆,制成组织匀浆液。
-水样处理:取适量的水样,4000r/min离心10min,取上清液,再以12000r/min离心20min,弃上清,沉淀用于核酸提取。
-底泥处理:称取适量的底泥,加入无菌生理盐水,振荡混匀,4000r/min离心10min,取上清液,按水样处理方法进一步处理。
核酸提取
-步骤
-取200μL组织匀浆液、水样沉淀或底泥处理后的上清液于1.5mL离心管中,加入20μL蛋白酶K和200μL裂解液,振荡混匀,56℃孵育30-60min
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