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基于先验知识挖掘的宫颈细胞图像实例分割方法
摘要
宫颈癌严重威胁着女性健康,及时发现和治疗至关重要。随着深度学习的快
速发展,计算机辅助诊断系统为宫颈癌的大规模筛查带来了希望。在宫颈癌辅助
诊断系统中,宫颈细胞的实例分割任务是非常重要的一环,它的目的是从宫颈细
胞图像中精确地分割出每个细胞的细胞质和细胞核。然而,由于宫颈细胞的特殊
性,这项任务面临着诸多挑战,例如细胞密集、容易聚集形成大面积的重叠和粘
连、甚至在视觉上无法区分单个细胞,同时受病人个体差异和染色风格等多种因
素影响,细胞样本风格差异较大。针对这些挑战,本文深入研究基于深度学习的
宫颈细胞核质实例分割方法,主要工作内容如下:
(1)针对海量宫颈细胞图像的标注数据获取困难的问题,提出了一种基于
人类视觉模拟的无监督宫颈细胞实例分割方法(HVS-Unsup)。该方法包括三个
阶段,第一个阶段利用宫颈细胞的多种先验知识生成伪标签。第二个阶段设计了
一个融合多种显式注意力的深度学习网络,设计并融合了细胞核特征增强模块
(NEM)和掩码辅助分割模块(MAS)来增强网络的多尺度特征学习,并针对第
一阶段生成的伪标签存在一定程度的漏检问题,设计了一个类别感知丢弃损失,
扩大网络解空间,使网络挖掘更多的假阴性实例。第三个阶段通过多轮的自训练
策略纠正错误标签,提升模型的分割精度。在私有数据集MS-CellSeg和公开数据
集Cx22和ISBI2015上的实验结果表明,HVS-Unsup在无监督宫颈细胞分割任务
上优于现有主流方法。
(2)针对宫颈细胞存在的重叠粘连,甚至视觉不可分等问题,提出了一种
基于主动学习的多分支实例分割网络(MBSeg)。首先,将HVS-Unsup作为预训
练模型,通过主动学习策略获得准确的像素级的标签,为MBSeg提供准确的标
注数据。接着,MBSeg在CondInst网络中新增了一种重叠分割分支,并引入交叉
熵损失以平衡正负样本之间的差异,赋予网络对重叠区域的学习能力,并与掩模
分支相融合,使掩模分支能够获得更准确的重叠区域感受野,提升分割精度。在
MS-CellSeg、Cx22和ISBI2015数据集上的实验证明了MBSeg在分割重叠细胞方
面的优越性。
(3)针对宫颈细胞图像的风格多样的问题,提出了一个基于结构先验的扰
动增强半监督宫颈细胞分割网络(SP-SemiSeg),该网络以MBSeg为深度学习模
型,采用教师-学生框架进行训练,并从多个角度探索更加广阔的扰动空间。在学
生模型训练时,添加了双流扰动分支和特征扰动分支,提高了学生模型的泛化
-I-
性,并提出了一种基于宫颈细胞的结构先验的对比损失,它根据细胞的结构先验
确定正样本和负样本,让学生模型的预测实例接近正样本的同时远离负样本,通
过模型的迭代训练减少假阳性和假阴性标签,提升模型性能。在Cx22和自建多
风格数据集上的实验结果证明了SP-SemiSeg方法的优越性,能有效的提升模型
的准确度和泛化性。
综上所述,针对宫颈细胞实例分割中的各种问题和挑战,本文提出了对应的
解决方案,并在多个宫颈细胞数据集上设计了大量实验验证了所提方法的有效
性。实验结果表明,所提出的HVS-Unsup方法可以在没有任何标注数据的情况下
获得接近全监督的性能,在实例分割网络中添加重叠分割分支可以有效提升重叠
区域的分割效果,提出的SP-SemiSeg方法在提升模型的鲁棒性方面具有巨大潜
力。
关键词宫颈细胞分割;无监督学习;主动学习;半监督学习;先验知识
-II-
Cervicalcellimageinstancesegmentationmethod
basedonpriorknowledgemining
Abstract
Cervicalcancerposesaseriousthreattowomenshealth,andtimelydetectionand
treatmentarecrucial.Withtherap
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