基于生物信息学分析结合rtpcr检测的肝细胞癌组织中mirna表达变化及意义.pdf

山东医药２０２０年第６０卷第１期

基于生物信息学分析结合ＲＴ￣ＰＣＲ检测的

肝细胞癌组织中ｍｉＲＮＡ表达变化及意义

冯青青ꎬ赵文文ꎬ赵文飞ꎬ于文静ꎬ闫文娴ꎬ魏红梅

青岛市中心医院山东青岛２６６０００

摘要:目的探讨基于生物信息学分析结合ＲＴ￣ＰＣＲ检测的肝细胞癌(ＨＣＣ)组织中微小ＲＮＡ(ｍｉＲＮＡ)表达变

化及意义ꎮ方法检索癌症基因组图谱(ＴＣＧＡ)数据库、高通量基因表达数据库(ＧＥＯ)中ＨＣＣ相关数据集ꎬ检索

时间截至２０１８年２月ꎬ用生物信息学分析肿瘤组织与正常组织之间ｍｉＲＮＡ的表达差异ꎬ在ＧＥＯ芯片集的ＨＣＣ组

织中验证差异表达的ｍｉＲＮＡꎮ用ＲＴ￣ＰＣＲ检测７６例份ＨＣＣ及癌旁组织中ｈｓａ￣ｍｉＲ￣１９１￣５ｐ、ｈｓａ￣ｍｉＲ￣２２１￣５ｐ表达ꎬ

并分析二者表达与患者临床病理特征的关系ꎮ结果在ＧＳＥ１２７１７筛选出４３个差异表达ｍｉＲＮＡ(Ｐ０.０５ꎬ｜Ｆｏｌｄ

ｃｈａｎｇｅ｜≥１)ꎬＧＳＥ１０６９４筛选出５０个差异表达ｍｉＲＮＡ(Ｐ０.０５ꎬ｜Ｆｏｌｄｃｈａｎｇｅ｜≥０.５)ꎬ在ＴＣＧＡ中筛选出１０１个差

异表达ｍｉＲＮＡ(Ｐ０.０５ꎬ｜Ｆｏｌｄｃｈａｎｇｅ｜≥１)ꎮｈｓａ￣ｍｉＲ￣２２１￣５ｐ、ｈｓａ￣ｍｉＲ￣１９１￣５ｐ在两个ＧＥＯ数据集中呈现差异表

达ꎬ但在ＴＣＧＡ中未检测出二者表达差异ꎮＨＣＣ及其癌旁组织中ｈｓａ￣ｍｉＲ￣１９１￣５ｐ相对表达量分别为６.０３±１.８２、

０.９３±０.０８ꎬｈｓａ￣ｍｉＲ￣２２１￣５ｐ相对表达量分别为６.０３±１.８２、０.９３±０.０８ꎮＨＣＣ组织中ｈｓａ￣ｍｉＲ￣１９１￣５ｐ、ｈｓａ￣ｍｉＲ￣

２２１￣５ｐ表达均高于癌旁组织(Ｐ均０.０５)ꎮｈｓａ￣ｍｉＲ￣１９１￣５ｐ表达与ＨＣＣ的ＴＮＭ分期、转移复发有关(Ｐ均

０.０５)ꎬｈｓａ￣ｍｉＲ￣２２１￣５ｐ表达与ＨＣＣ的ＴＮＭ分期、转移复发、包膜浸润有关(Ｐ均０.０５)ꎻ二者表达与患者其他临

床病理特征无关(Ｐ均０.０５)ꎮ结论基于生物信息学分析结合ＲＴ￣ＰＣＲ检测的ＨＣＣ组织中ｈｓａ￣ｍｉＲ￣１９１、ｈｓａ￣

ｍｉＲ￣２２１呈高表达ꎬ二者可能参与ＨＣＣ的恶性进展ꎮ

关键词:肝细胞癌ꎻ微小ＲＮＡꎻ生物信息学ꎻ逆转录聚合酶链反应

ｄｏｉ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１００２￣２６６Ｘ.２０２０.０１.００２

中图分类号:Ｒ７３５.７文献标志码:Ａ文章编号:１００２￣２６６Ｘ(２０２０)０１￣０００５￣０５

ＣｈａｎｇｅｓａｎｄｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅｏｆｍｉＲＮＡｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｉｎｈｅｐａｔｏｃｅｌｌｕｌａｒｃａｒｃｉｎｏｍａｂａｓｅｄ

ｏｎｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｃｏｍｂｉｎｅｄｗｉｔｈＲＴ￣ＰＣＲ

ＦＥＮＧＱｉｎｇｑｉｎｇꎬＺＨＡＯＷｅｎｗｅｎꎬＺＨＡＯＷｅｎｆｅｉꎬＹＵＷｅｎｊｉｎｇꎬＹＡＮＷｅｎｘｉａｎꎬＷＥＩＨｏｎｇｍｅｉ

ＱｉｎｇｄａｏＣｅｎｔｒａｌＨｏｓｐｉｔａｌꎬＱｉｎｇｄａｏ２６６０００ꎬＣｈｉｎａ

Ａｂｓｔｒａｃｔ:ＯｂｊｅｃｔｉｖｅＴｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｃｈａｎｇｅｓａｎｄｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅｏｍｉＲＮＡｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｉｎｈｅｐａｔｏｃｅｌｌｕｌａｒｃａｒｃｉｎｏｍａ

(ＨＣＣ)ｔｉｓｓｕｅｓｂａｓｅｄｏｎｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｃｏｍｂｉｎｅｄｗｉｔｈＲＴ￣ＰＣＲ.ＭｅｔｈｏｄｓＴｈｅＨＣＣ￣ｒｅｌａｔｅｄｄａｔａｓｅｔｓｉｎｔｈｅＣａｎｃｅｒＧｅ￣

ｎｏｍｅＡｔｌａｓ(ＴＣＧＡ)ｄａｔａｂａｓｅａｎｄｔｈｅＨｉｇｈ￣ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔＧｅｎｅＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎＤａｔａｂａｓｅ(ＧＥＯ)ｗｅｒｅｓｅａｒｃｈｅｄ.Ｔｈｅｄｅａｄｌｉｎｅｆｏｒ

ｏｕｒｓｅａｒｃｈｗａｓＦｅｂｒｕａｒｙ２０１８.ＴｈｅｄｉｅｒｅｎｃｅｉｎｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｏｍｉＲＮＡｂｅｔｗｅｅｎｔｕｍｏｒｔｉｓｓｕｅａｎｄｎｏｒｍａｌｔｉｓｓｕｅｓｗａｓａｎａ￣

ｌｙｚｅｄｉｎｔｈｅＧＥＯｃｈｉｐ.ＤｉｅｒｅｎｔｉａｌｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｍｉＲＮＡｓｗｅｒｅｖｅｒｉｆｉｅｄｉｎｓｅｔｓｏＨＣＣ