大规模生物序列比对算法及其并行化的深度探究与实践.docx

大规模生物序列比对算法及其并行化的深度探究与实践

一、引言

1.1研究背景与意义

生物信息学作为一门融合了生物学、计算机科学和统计学等多学科知识的交叉领域，在现代生命科学研究中扮演着举足轻重的角色。随着高通量测序技术的迅猛发展，生物序列数据正以前所未有的速度增长，这些数据涵盖了从微生物到人类等各种生物的基因组、转录组和蛋白质组信息。面对如此海量且复杂的数据，如何高效地从中挖掘出有价值的生物学信息，成为了生物信息学领域亟待解决的关键问题。

序列比对作为生物信息学的核心技术之一，旨在通过比较不同生物序列之间的相似性和差异性，揭示序列间的进化关系、功能相关性以及结构特征。在基因功能预测方面，通