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高分辨质谱法在代谢组学分析中的应用及计算方法研究
目录
内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1.1代谢组学研究概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.1.2高分辨质谱技术发展历程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.1.3高分辨质谱法在代谢组学中的应用价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
1.2.1高分辨质谱技术平台进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
1.2.2代谢组学数据分析方法综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
1.2.3研究存在的挑战与不足．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
1.3.1研究目标设定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
1.3.2主要研究内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
高分辨质谱技术原理及代谢组学样品前处理．．．．．．．．．．．．．．．．．20
2.1高分辨质谱仪器类型与工作原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
2.1.1离子源技术分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
2.1.2质量分析器原理探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
2.1.3数据采集模式比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
2.2代谢组学样品制备方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
2.2.1生物样品采集与保存策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
2.2.2提取溶剂选择与优化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
2.2.3样品净化与浓度调整技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
高分辨质谱代谢组学数据预处理方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
3.1数据格式转换与质量控制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
3.1.1常见数据格式介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
3.1.2数据质量评估指标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
3.1.3数据预处理流程规范．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
3.2基峰提取与峰对齐．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
3.2.1基峰提取算法比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
3.2.2多维数据对齐策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47
3.2.3对齐偏差校正方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48
3.3数据峰平滑与缺失值填充．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49
3.3.1常用峰平滑算法分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50
3.3.2缺失值估计方法探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
3.3.3数据一致性检验．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
高分辨质谱代谢组学数据解析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57
4.1化学物质信息检索与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58
4.2代谢物丰度定量分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59
4.2.1内标法与绝对定量策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60
4.2.2代谢物相对定量技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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