基于SNP-array的全基因组单体型分析在病理性小拷贝数变异的植入前遗传学检测中的拓展应用.pdfVIP

.1620.生殖医学杂志2024年12月第33卷第12期

DO1:10.3969/j.issn.1004-3845.2024.12.010

基于SNP-array的全基因组单体型分析在病理性

小拷贝数变异的植入前遗传学检测中的拓展应用

王静，马远林*，郭婧，李荣，潘家富

（中山大学附属第一医院，广东省生殖医学重点实验室，广州510080）

【摘要】目的探讨基于单核苷酸微阵列技术(SNP-array的全基因组单体型分析在病理性小拷贝数变异（CNV）的植

人前遗传学检测（PGT)中的可行性和有效性。方法选择2020年5月至2023年11月在中山大学附属第一医院生殖中心

因一方携带有致病性小CNVs而要求行PGT的夫妇为研究对象。对常规ICSI受精后的囊胚进行活检，活检后的样本经全基

因组扩增后进行SNP-array的检测。构建家系单体型,在CNV所在区域,将胚胎单体型与家系中携带致病性小CNVs的先证

者单体型进行比对，确定胚胎是否带有风险单体型，从而确定胚胎是否携带有致病性小CNV。结果共完成14个PGT周

期,活检胚胎数71个,其中39个胚胎未遗传上一代的致病性小CNVs,29个胚胎带有致病性CNVs,3个胚胎为X染色体

CNVs的携带者。目前完成移植周期9个，其中6个移植周期成功获得临床妊娠，已有5例行羊膜腔穿刺术，结果均未发现遗

传了上一代的致病性CNVs。活产婴儿3个，出生后随访迄今为止均显示身体健康。所有家系的产前诊断结果与胚胎检测结

果一致。结论基于SNP-array的全基因组单体型分析对低于植人前非整倍体筛查（PGT-A)检测范围的小片段CNV具

有一定的有效性和可行性。另外，通过对定制的大量SNP位点进行定量分析，还可以同时完成胚胎的非整倍体筛查。

【关键词】拷贝数变异；植人前遗传学检测；单核苷酸微阵列技术；单体型分析

【中图分类号】R714.8【文献标识码】A

Expandedapplicationofwhole-genomehaplotypeanalysisbasedonSNP-arrayinpreimplantationgenetic

testingforpathogenicsmallcopynumbervariations

WANGJing,MAYuan-lin*,GUOJing,LIRong,PANJia-fu

TheFirstAffiliatedHospital,SunYat-senUniversity,GuangdongProvincialKeyLaboratoryof

ReproductiveMedicine,Guangzhou510080

[Abstract]

Objective:Toexplorethefeasibilityandeffectivenessofwhole-genomehaplotypeanalysisbasedon

singlenucleotidemicroarraytechnology(SNP-array)inpreimplantationgenetictesting(PGT)forlessthan

5Mbofpathologicalcopynumbervariations(CNV).

Methods:CoupleswhosoughtforPGTduetopathogenicsmallCNVsattheReproductiveCenterof

theFirstAffiliatedHospitalofSunYat-senUniversityfromMay2020toNovember2023wererecruited.

TheblastocystsfertilizedthroughconventionalICSIwerebiopsied,andthebiopsiedsamplesweresubjected

towhole-genomeamplificationandSNP-arraydetection.Thefamilyhaplotypewasconstructed,andthe

embryohaplotypewasc