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微生物的现代分类鉴定方法---遗传分类法食品质量与安全专业教学资源库Theteachingresourcelibraryoffoodqualityandsafety主讲教师:鲁慧芳河南农业职业学院《食品微生物控制技术》
目录ContentsDNA中(G+C)含量的分析1DNA-DNA杂交2DNA-rRNA杂交316SrRNA(16SrDNA)寡核苷酸的的序列分析4
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA中(G+C)含量的分析DNA中(G+C)含量分析主要用于区分细菌的属和种,DNA碱基比例主要是指(G+C)含量[通常用(G+C)mol%表示],即为鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)在整个DNA中含量的数值是恒定的,不会随着环境条件、培养条件等的变化而变化。
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA中(G+C)含量的分析在同一属不同种之间,DNA中(G+C)含量的数值不会差异太大,可在某个数值为中心成簇分布,线束同属微生物种的(G+C)含量范围。一般情况下,细菌DNA中(G+C)含量的变化范围一般在25-75%。而放线菌DNA中(G+C)含量范围非常窄(25-75%)。
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA中(G+C)含量的分析一般认为,任何两种微生物在(G+C)含量上的差别超过了10%,这两种微生物就肯定不是同一种。因此可以利用(G+C)含量来鉴别各种微生物种属间亲缘关系及远近程度。常用热变性程序法即用紫外分光光度计测定DNA的溶解温度Tm的方法来测定(G+C)的含量。
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA中(G+C)含量的分析值得注意的是,亲缘相近的菌,其(G+C)含量相同或者相似,但(G+C)含量相同或者相似的菌,其亲缘关系不一定相近,这是因为这一数据还不能反映出碱基对的排列序列。要比较两对菌的DNA碱基对排列序列是否相同以及相同的程度如何,就需要做核酸杂交实验。
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA-DNA杂交其原理是用DNA解链的可逆性和碱基配对的专一性,将不同来源的DNA在体外加热解链,并在合适的条件下,互补的碱基重新配对结合成双链DNA,然后根据能生成双链的情况,检测杂合百分数。
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA-DNA杂交如果两条单链DNA的碱基序列只有部分相同,则它们能生成的“双链”仅含有局部单链,其杂合率小于100%。因此,杂合率越高,表示两个DNA之间碱基序列的相似性越高,它们之间的亲缘关系也就越近。
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA-DNA杂交许多资料表明,DNA-DNA杂交最适合于微生物种一级水平的研究。1981年,约翰逊的实验指出,DNA-DNA杂交同源性在60%以上的菌株可以视为同一个种,同源性低于20%者为不同属的关系,同源性在20%-30%可以视为属内紧密相关的种。
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA-rRNA杂交在生物进化过程中,rRNA碱基系列的变化比基因组慢,它甚至保留了古老祖先的一些碱基序列。所以,当两个菌株的DNA-DNA杂交率很低或者不能杂交时,用DNA-rRNA杂交仍可能出现比较高的杂交率,因而可以用来进一步比较关系更远的菌株之间的关系,进行属或属以上等级分类单元的分类。
34请输入您的文字对实际情况进行说明DNA-rRNA杂交DNA-rRNA杂交的基本原理,实验方法同DNA杂交一样,不同的是1.DNA杂交中同位素标记的部分是DNA,而DNA-rRNA杂交的同位素标记的部分是rRNA。2.DNA杂交结果用同源性百分比数表示,而DNA-rRNA杂交结果用Tm(e)和RNA结合数表示。
34请输入您的文字对实际情况进行说明16SrRNA(16SrDNA)寡核苷酸的的序列分析16SrRNA普遍存在于原核生物(真核生物中其同源分子是18SrRNA)中。16SrRNA分子中既含有高度保守的序列区域,又有中度保守和高度变化的序列区域,因此它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究。16SrRNA的相对分子质量大小适中,约1540个核苷酸,便于序列分析。因此,它可能作为测量各类生物进化和亲缘关系的良好工具。
34请输入您的文字对实际情况进行说明16SrRNA(16SrDNA)寡核苷酸的的序列分析应用16SrRNA核苷酸序列分析法进行微生物分类鉴定,首先要将微生物进行培养,然后提取并纯化16SrRNA,进行16SrRNA序列测定,将所得序列通过Blast程序与Geneb
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