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第十一章微生物的分类鉴定教学内容了解分类的单元掌握微生物的命名方法了解微生物的分类系统了解微生物的鉴定12

分类(classification)：根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。(根据现有数据建立系统的过程)分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：鉴定分类、命名、

命名(nomenclature)：根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称；(分类系统建立过程中的步骤之一)鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。(根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程)

主要以细菌为例介绍微生物分类、命名和鉴定的有关知识

界门纲目科属种微生物分类单元及等级第一节分类单元

根据CarlWoese的理论，现在还在界之上使用域(domain)（把全部生物先分为古生菌域、细菌域和真核生物域，域下面再分界。）

种又称物种，是微生物分类学最基本的分类单位。但是至今，关于种的概念还没有形成一个统一的定义，争论较大。一般认为：微生物的种是一个基本的分类单位，是一群表型特征高度相似、亲源关系极其相近、与同属内的其他种有着明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作它的具体代表，故此典型菌株成了该种的模式种，如产黄青霉PenicilliumchrysogenumNRRL-Q176。010203二.种的定义

为了使用方便，在种以下人们又提出了许多分类单元，这些分类单元不是正式的分类单位，因此，也没有得到国际公认。亚种(Subspecies，subsp.,ssp.)当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性状又不足以区分为新种时，可将这些菌株细分为两个或更多的小的分类单元--亚种。亚种是微生物分类中具有正式分类地位的最低等级。亚种是在种的加词后写上“subsp.”，再写上具体的亚种的加词。蜡状芽孢杆菌亚种：Bacilluscereussubsp.mycoides三.种以下的分类单元

2.变种(Variety,var.)变种是亚种的同义词，因易引起混乱，故《国际细菌命名法规》(1975)已规定它在命名法中没有地位，且不主张使用。3.型(Form)是亚种以下的分类单位，仅作若干变异型的后辍。常见的有生物变异型、形态变异型、血清变异型、致病变异型、噬菌体变异型等。

培养物(culture)：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。菌株(strain)：菌株是指任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其后代。从自然界中分离到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法(如通过诱变)所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。4.常用的细菌分类学术语：

菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体。由于同种或同一亚种的不同菌株之间，某些生物学特性可能存在一定差异，如一些生化性状、代谢产物的产量性状等。因此在实际工作中，除了注意菌株的种名外，还要注意菌株的名称。菌株的名称可随意确定，一般都放在学名（即只有属名和种的加词者）的后面，可随意用字母加编号表示，如：EscherichiacoliK12123

区域性的俗名；是一个国家或地区使用的普通名称，如结核杆菌（结核分枝杆菌）、红色面包霉（粗糙脉孢霉）；具有大众化和简明等优点，但不便于国际间的交流。微生物名称分为两类：学名；是某一菌种的科学名称，是按“国际命名法规”命名并受国际学术界公认的通用正式名称。物种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组成。要求印刷为斜体，或书写时在学名下划线。学名的表示方法有双名法和三名法两种。第二节微生物的命名方法

双名法是指一个种的学名由属名和种的加词两部分组成。01属名的词首须大写，种名加词的字首须小写。01出现在分类学文献中的学名，在两部分之后还应加写3项内容（均排正体字），即首次定名人（用括号括住）、现名定名人和现名的定名年份。如在一般书刊中出现时可省后3项。01一.双名法

通式：学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现在定名人+定名年份例:(1)枯草芽孢杆菌Bacillussubtilis(Ehrenberg)Cohn1872例如:(2)大肠杆菌Escherichiacoli(Migula)Castellani