常见酶切位点与保护碱基.docVIP

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不同内切酶对辨认位点以外至少保护碱基数目旳规定

不同内切酶对辨认位点以外至少保护碱基数目旳规定

寡核苷酸序列

切割率%

2hr

20hr

AccI

GGTCGACC?CGGTCGACCG

CCGGTCGACCGG

0?0

0

0?0?0

AflIII

CACATGTG?CCACATGTGG

CCCACATGTGGG

0

90

90

0

>90?90

AscI

GGCGCGCC?AGGCGCGCCT?TTGGCGCGCCAA

90

90

>90

90

90

90

AvaI

CCCCGGGG

CCCCCGGGGG

TCCCCCGGGGGA

50

90?90

90?>90

90

BamHI

CGGATCCG

CGGGATCCCG

CGCGGATCCGCG

10?>90?90

25

90?90

BglII

CAGATCTG

GAAGATCTTC

GGAAGATCTTCC

0?75?25

0?>90?90

BssHII

GGCGCGCC

AGGCGCGCCT?TTGGCGCGCCAA

0

50

0?0

90

BstEII

GGGT(A/T)ACCC

0

10

BstXI

AACTGCAGAACCAATGCATTGG

AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA

CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT

0

25

25

50

>90

ClaI

CATCGATG

GATCGATC

CCATCGATGG

CCCATCGATGGG

0?0

90?50

0?0

90?50

EcoRI

GGAATTCC?CGGAATTCCG?CCGGAATTCCGG

>90

90?90

90

90?90

HaeIII

GGGGCCCC?AGCGGCCGCT?TTGCGGCCGCAA

>90?>90?90

90

90?90

HindIII

CAAGCTTG?CCAAGCTTGG

CCCAAGCTTGGG

0?0

10

0

0

75

KpnI

GGGTACCC?GGGGTACCCC

CGGGGTACCCCG

0

90

90

>90

90

MluI

GACGCGTC

CGACGCGTCG

0

25

0

50

NcoI

CCCATGGG

CATGCCATGGCATG

0

50

75

NdeI

CCATATGG?CCCATATGGG

CGCCATATGGCG?GGGTTTCATATGAAACCC

GGAATTCCATATGGAATTCC

GGGAATTCCATATGGAATTCCC

0?0?0?0?75

75

0?0

0

0

90?90

NheI

GGCTAGCC

CGGCTAGCCG

CTAGCTAGCTAG

0?10?10

25?50

?

寡核苷酸序列

切割率%

2hr

20hr

NotI

TTGCGGCCGCAA

ATTTGCGGCCGCTTTA

AAATATGCGGCCGCTATAAA

ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT?AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA

0?10

10

25?25

0?10

10

90?90

NsiI

TGCATGCATGCA?CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT

10

90

>90?90

PacI

TTAATTAA

GTTAATTAAC?CCTTAATTAAGG

0

0

0

25?>90

PmeI

GTTTAAAC?GGTTTAAACC

GGGTTTAAACCC

AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG

0

0

0?75

0?25?50?90

PstI

GCTGCAGC

TGCACTGCAGTGCA?AACTGCAGAACCAATGCATTGG

AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA

CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT

0?10

90?>90?0

0

10?>90

>90?0

PvuI

CCGATCGG?ATCGATCGAT?TCGCGATCGCGA

0?10

0

0?25?10

SacI

CGAGCTCG

10

10

SacII

GCCGCGGC

TCCCCGCGGGGA

0?50

0?90

S

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