动物基因组学：蛋白质结构预测_（7）.同源建模技术.docx

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同源建模技术

同源建模（HomologyModeling）是一种基于已知蛋白质结构预测未知蛋白质结构的计算方法。当一个蛋白质的三维结构未知，但其氨基酸序列与一个或多个已知结构的蛋白质有较高的相似性时，可以通过同源建模技术来预测其三维结构。这种技术在动物基因组学中尤为重要，因为许多动物蛋白质的结构尚未被实验确定，而通过同源建模可以快速获得这些蛋白质的结构模型，从而进一步研究其功能和作用机制。

1.同源建模的基本原理

同源建模的基本原理是利用已知的蛋白质结构（模板，Template）来推断未知蛋白质的结构（目标，Target）。具体步骤包括：

序列比对：