单细胞转录组学结合生物信息学综合分析缺血性脑卒中巨噬细胞亚群及枢纽基因.pdfVIP

细胞与分子免疫学杂志(ＣｈｉｎＪＣｅｌｌＭｏｌＩｍｍｕｎｏｌ)２０２５ꎬ４１(６)５０５

论著文章编号:１００７￣８７３８(２０２５)０６￣０５０５￣０９

单细胞转录组学结合生物信息学综合分析缺血性脑卒中巨噬细胞亚群及

枢纽基因

１２１２１∗２∗１２

徐敬尧ꎬ王小璐ꎬ侯帅ꎬ庞萌ꎬ王刚ꎬ王炎强(山东第二医科大学附属医院:急诊科ꎬ神经内二科ꎬ山东潍坊２６１０３１)

[摘要]目的利用单细胞转录组(ｓｃＲＮＡ￣ｓｅｑ)数据分析ꎬ高维加权基因共表达网络分析(ｈｄＷＧＣＮＡ)探索缺血性脑卒中(ＩＳ)

巨噬细胞亚群ꎮ方法基于单细胞测序数据获得不同细胞类型的转录组信息ꎬ并选择巨噬细胞进行亚群鉴定ꎮ利用ｈｄＷＧＣＮＡ、细

胞通讯和拟时序分析等方法探讨ＩＳ后巨噬细胞的亚群特征ꎬ并结合芯片数据筛选出与ＩＳ相关的枢纽基因进行接收者操作特征

(ＲＯＣ)分析验证其诊断价值ꎬ通过基因集富集分析(ＧＳＥＡ)探究其潜在功能ꎮ结果ｓｃＲＮＡ数据分析显示ＩＳ后巨噬细胞的亚

群组成显著变化ꎬ其中一个巨噬细胞亚群在卒中组中富集ꎬ命名为ＭＣＡＯ￣特异性巨噬细胞(ＭＳＭ)ꎮ拟时序分析表明ꎬＭＳＭ处

于巨噬细胞分化的中间阶段ꎮ细胞通讯分析揭示ＭＳＭ与其他细胞间存在复杂相互作用ꎬＣＣ基序趋化因子配体６/ＣＣ基序趋化

因子受体１(ＣＣＬ６/ＣＣＲ１)信号轴可能在神经炎症中发挥重要作用ꎮｈｄＷＧＣＮＡ识别出与ＭＳＭ相关的两个基因模块ꎬ显著富集

于核苷酸结合寡聚结构域样受体(ＮＬＲ)和抗原加工等信号通路ꎮ通过筛选ＭＳＭ差异基因与常规转录组数据ꎬ识别精氨酸酶１

(Ａｒｇ１)、Ｃ型凝集素结构域家族４成员Ｄ(ＣＬＥＣ４Ｄ)和Ｃ型凝集素结构域家族４成员Ｅ(ＣＬＥＣ４Ｅ)这３个与ＩＳ相关的枢纽基因ꎮ

结论本研究揭示了ＩＳ后巨噬细胞亚群的特征及其功能ꎬ筛选出３个具有潜在诊断价值的枢纽基因ꎬ可能为完善ＩＳ的病理机

制提供了新的见解ꎮ

[关键词]缺血性脑卒中(ＩＳ)ꎻ巨噬细胞ꎻ拟时序分析ꎻ高维加权基因共表达网络分析(ｈｄＷＧＣＮＡ)ꎻ细胞通讯

[中图分类号]Ｒ３９２ꎬＲ５４３ꎬＲ３６４.４ꎬＲ７４３[文献标志码]Ａ

Ｓｉｎｇｌｅ￣ｃｅｌｌｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｉｃｓｃｏｍｂｉｎｅｄｗｉｔｈｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｆｏｒｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅａｎａｌｙｓｉｓ

ｏｆｍａｃｒｏｐｈａｇｅｓｕｂｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓａｎｄｈｕｂｇｅｎｅｓｉｎｉｓｃｈｅｍｉｃｓｔｒｏｋｅ

１２１２１∗２∗

ＸＵＪｉｎｇｙａｏꎬＷＡＮＧＸｉａｏｌｕꎬＨＯＵＳｈｕａｉꎬＰＡＮＧＭｅｎｇꎬＷＡＮＧＧａｎｇꎬＷＡＮＧＹａｎｑｉａｎｇ

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ＥｍｅｒｇｅｎｃｙＤｅｐａｒｔｍｅｎｔꎬＡｆｆｉｌｉａｔｅｄＨｏｓｐｉｔａｌｏｆＳｈａｎｄｏｎｇＳｅｃｏｎｄＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＮｅｕｒｏｌｏｇｙⅡꎬＡｆｆｉｌｉａｔｅｄＨｏｓｐｉｔａｌｏｆ

ＳｈａｎｄｏｎｇＳｅｃｏｎｄＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＷｅｉｆａｎｇ２６１０３１ꎬＣｈｉｎａ

∗ＣｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒｓꎬＥ￣ｍａｉｌ:３８１８８１５７９＠ｑｑ.ｃｏｍꎻｗａｎｇｑｉａｎｇｄｏｃｔｏｒ＠１２６.ｃｏｍ

[Ａｂｓｔｒａｃｔ]ＯｂｊｅｃｔｉｖｅＴｏｅｘｐｌｏｒｅｍａｃｒｏｐｈａｇｅｓｕｂｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓｉｎｉｓｃｈｅｍｉｃｓｔｒｏｋｅ(ＩＳ)ｂｙｕｓｉｎｇｓｉｎｇｌｅ￣ｃｅｌｌＲＮＡｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ

(ｓｃＲＮＡ￣ｓｅｑ)ｄａｔａａｎａｌｙｓｉｓ