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广东农业科学GuangdongAgriculturalSciences2024,51(10):17-30DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2024.10.002
高洁,相楚嫣,赵俊宏,潘启明,杨凤玺.‘红太阳’墨兰不同叶色时期的转录组和代谢组联合分析[J].广东农业科学,2024,51(10):17-30.
GAOJie,XIANGChuyan,ZHAOJunhong,PANQiming,YANGFengxi.JointanalysisoftranscriptomeandmetabolomeatdifferentleafcolorstagesofCymbidium
sinense‘RedSun’[J].GuangdongAgriculturalSciences,2024,51(10):17-30.
优秀青年学者论坛
高洁,博士,副研究员,广东省农业科学院环境园艺研究所兰花研究室副主任,兼任广东省兰花协
会监事长等职务,从事兰科花卉种质鉴评、分子遗传机理、新品种选育和栽培管理技术研究。主持
国家自然科学基金、国家重点研发计划子课题等国家和省、市级科研项目7项,入选广东省农业科
学院优秀中青年科技人才培养项目。获农业农村部神农中华农业科技奖优秀创新团队奖1项(排名
第6)。发表学术论文20余篇,其中以第一作者发表SCI论文6篇。与多家花卉产业龙头企业、现
代农业产业园、专业户等建立联系,定期开展花卉技术及产业发展研讨会、品种推广会、技术培训会,
助推现代农业技术推广和兰花产业化水平提升。
‘红太阳’墨兰不同叶色时期的转录组
和代谢组联合分析
12341
高洁,相楚嫣,赵俊宏,潘启明,杨凤玺
(1.广东省农业科学院环境园艺研究所/广东省园林花卉种质创新与利用重点实验室,
广东广州510640;2.广州中医药大学中药学院,广东广州510006;
3.广东省农业科学院设施农业研究所,广东广州510640;
4.肇庆雅兰芳农业科技有限公司,广东肇庆526200)
摘要:【目的】探明‘红太阳’墨兰不同叶色变化过程中相关基因的变化模式,为墨兰叶色改良提供指导。【方
法】利用IlluminaHiSeq高通量测序平台对‘红太阳’墨兰红色、黄色以及绿色叶片进行测序,分析差异表达基因
的富集通路,同时对转录组和代谢组数据进行联合分析,并对筛选出的关键差异基因进行荧光定量PCR的验证。【结
果】从红叶向黄叶转变过程中一共筛选到861个差异基因(DEGs),其中上调基因数为204个、下调基因数为657个;
从黄叶向绿叶转变过程中一共筛选到815个差异基因,其中上调基因有492个、下调基因有323个。KEGG通路富
集分析结果显示,与色素合成和代谢相关通路上的基因在‘红太阳’墨兰叶色变化过程中均出现显著富集。在叶色
转变过程中,MYB、NAC、WRKY以及bHLH转录因子家族的表达量出现显著性差异。与代谢组数据联合分析发现,
黄酮类、异黄酮类化合物、黄酮和黄酮醇以及代谢物合成途径中的差异基因和差异代谢物在‘红太阳’墨兰叶色变
化过程中显著富集。类黄酮代谢途径中共鉴定出26个差异表达基因,这些基因在红叶向黄叶转变过程中均表现出
显著下调,5种差异代谢物的含量在这一转变过程中显著下降。在黄叶向绿叶的转变中,17个基因和2种代谢物(新
橙皮苷和柚皮苷查尔酮)表现出显著差异。【结论】花青苷合成前体物质含量以及相关合成酶基因表达量的降低导
致‘红太阳’墨兰叶片红色逐渐消失,光合色素合成相关基因的高表达是导致‘红太阳
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