基于SLAF-Seq技术的辣椒抗炭疽病QTL定位分析及SSR分子标记开发.pdfVIP

南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2025，56（2）：633-642

ISSN2095-1191；CODENNNXAAB

DOI：10.3969/j.issn.2095-1191.2025.02.027

基于SLAF-Seq技术的辣椒抗炭疽病QTL

定位分析及SSR分子标记开发

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李怡斐，段敏杰，黄任中，黄启中，王春萍，张世才

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（重庆市农业科学院蔬菜花卉研究所，重庆401329；重庆市农业科学院生物技术研究所逆境农业研究

重庆市重点实验室，重庆401329）

摘要：【目的】利用SLAF-Seq技术对辣椒抗炭疽病QTL进行定位分析，开发与炭疽病抗性QTL紧密连锁的分子标

记，为辣椒抗炭疽病分子标记辅助选择育种提供理论参考。【方法】以抗病材料PPTC26-3-1-1-1-1-1和感病材料1287为

亲本构建F代群体，并采用SLAF-Seq技术进行分子标记开发，构建高密图遗传连锁图谱。结合表型数据，利用复合

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区间作图法（CIM）对辣椒果实转色期的炭疽病抗性进行QTL分析。利用Microsatellite（MISA）在定位区间识别SSR

位点。【结果】从亲本和子代样品共获得423351627条Reads，其中，来自PPTC26-3-1-1-1-1-1和1287分别为8130516和

6621396条，F代群体120个子代样品的平均Reads数量。构建包含4671个SNP分子标记、分布于12个连

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锁群、总图距为1567.53cM、平均图距为0.34cM的辣椒高密度遗传图谱，检测到1个炭疽病抗性相关的QTL

（CaR10.1），位于10号连锁群上187930592~189766111bp物理区间内。共有23个基因定位在关联区域内，根据基因功

能注释，其中1个基因编码假定晚疫病抗性蛋白同源物R1B-23异构体X2，1个基因编码PPR蛋白，可能与辣椒果实转

色期炭疽病抗性相关。在关联到的QTL区间内开发出SSR分子标记T482，在F代群体中的验证结果显示，T482引物

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在F代群体单株中扩增结果与表型鉴定结果一致。F代群体抗病和中抗单株中有53株具有抗病亲本的条带，有25株

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同时具有抗病亲本和感病亲本的条带；F代群体感病单株中，有42株具有感病亲本的条带。【结论】构建高密度遗传连

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锁图谱，将辣椒果实转色期炭疽病抗性定位于10号连锁群，在关联区间开发出SSR分子标记T482，可初步鉴别辣椒果

实转色期炭疽病抗性，同时结合针刺接种法鉴定，可提高鉴定的准确率。

关键词：辣椒；SLAF-Seq；遗传图谱；炭疽病；QTL；SSR分子标记

中图分类号：S641.303.6文献标志码：A文章编号：2095-1191（2025）02-0633-10

QTLlocalizationanalysisandSSRmolecularma