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分子植物育种,2020年,第18卷,第21期,第7104-7114页
MolecularPlantBreeding,2020,Vol.18,No.21,7104-7114
研究报告
ResearchReport
两个油梨品种转录组SSR特征比较分析及其分子标记开发
郭俊u朱婕u谢尚潜u张叶12叶蓓蕾w郑丽燕u凌鹏0
1海南大学,热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室,海口,570228;2海南大学园艺学院,海口,570228;3海南大学林学院,海口,
570228
*通信作者163.com
摘要本研究通过对‘哈斯’(Hass)与‘福尔特’(Fuert)2个油梨品种转录组中SSR位点特征进行比较分
析,设计引物并验证其多态性,为油梨开发新的SSR分子标记提供数据基础。利用MISA软件分别从油梨品
种‘Hass’和‘Fuert’的转录组数据中发现SSR序列6449个和6312个。统计结果显示,二核苷酸重复类型
数量最多,占‘Hass’和‘Fuert’SSR总数的48.44%和48.32%,AG/CT为出现频率最高的核苷酸重复基元,
在‘Hass’中共2477个(38.41%),在‘Fuert’中共2478个(39.26%);各核苷酸重复类型在5次重复中出现的
次数最多,‘Hass’品种中为1539次,占比为23.86%,在‘Fuert’中为1543次(24.45%);两个品种最优势的
10个微卫星类型相同;‘Hass’品种特有重复基元26种,‘Fuert’品种特有重复基元32种。用Primer3.0软件
为‘Hass’、‘Fuert’油梨转录组SSR序列成功设计出13686、13398对引物。随机选择25对引物对8份油梨
种质资源进行多态性检测,分别得到11和丨0对多态性引物,多态性比率分别为44%和40%。本研宄结果表
明,两个油梨品种微卫星分布特征基本一致,油梨转录组可作为开发SSR分子标记的有效来源,得到的大量
SSR标记可为油梨的遗传多样性分析、亲缘关系鉴定及分子标记育种提供理论依据。
关键词油梨(Perseaa/7iericanaMill.),转录组,SSR彳目息,多态性,分子标记
ComparativeAnalysisofTranscriptomeSSRCharacteristicsandDevelopm
entofMolecularMarkersofTwoAvocadoVarieties
GuoJunZhuJieuXieShangqian13ZhangYeuYeBeileiuZhengLiyanuLingPeng
1KeyLaboratoryofGeneticsandGermplasmInnovationofTropicalSpecialForestTrsandOrnamentalPlants,HainanUniversity,MinistryofEdu
cation,Haikou,570228;2CollegeofHorticulture,HainanUniversity,Haikou,570228;3ForestryCollege,HainanUniversity,Haikou,570228
*Co
初级会计持证人
专注于经营管理类文案的拟写、润色等,本人已有10余年相关工作经验,具有扎实的文案功底,尤善于各种框架类PPT文案,并收集有数百万份各层级、各领域规范类文件。欢迎大家咨询!
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